曾文溪口由於上游带来丰富的营养盐，成为各种生物群聚的栖息地，其鸟种以鹬科、鸥科与鹭科为主，如滨鹬、东方环颈鴴等，在候鸟过境期间，数量丰富。黑面琵鹭在台湾最早的记载可溯及1863年（同治2年），20世纪中期黑面琵鹭成为濒临绝种的鸟类，大部分於9月至隔年4月出现於曾文溪口及邻近地区。2002年台南县政府於曾文溪口北岸公告划设黑面琵鹭野生动物保护区及野生动物重要栖息环境。
植物分布多以耐盐度高的滨海植物为主，沙洲上常见的滨海植物有马鞍藤、滨水菜、滨刺麦。在七股溪口有大片红树林生长，主要是海茄苳纯林。滨海防风林以木麻黄为主，夹杂黄槿、苦楝、雀榕等植物。
此区是台江内海的一部分，水质良好，曾记录约30种蟹类及200种贝类，虱目鱼与牡蛎为主要养殖种类，并有石斑、黑鲷、乌鱼等对水质要求极高的高级鱼类。
中文关键字： 曾文溪 , 黑面琵鹭 , 红树林 , 台江内海
英文关键字Zengwun River , Black-faced spoonbill , Mangrove , Taijiang lagoon
参考资料