凤山国中站有3座出入口，外观设计是1种别致，有别於其他各站的波浪海洋意象，凤山国中站走的是科技意象，站体全以蓝绿色的玻璃维幕构成，出入口正面为白色珐琅，一改橘色门面的作风。最大的是3号出入口，除了站体面积放大1倍外，旁边还有1座全以玻璃维幕构成的高塔，辅以平行的散热孔，远而观之，高塔就像电脑主机，出入口就像旧式电脑萤幕般。
2号出入口位於凤山大邮局旁，出入口的墙面、屋顶完全使用玻璃，让站体更富视觉的穿透性。倾斜而不中肯的玻璃维幕，让方型的站体增添了移动之感，就好像是伸缩的小盒子般。
3座出入口的设计采取科技电子风格，藏在蓝绿色玻璃维幕之内的，是大片的迷彩风格。这些迷彩意象来自於车站附近的陆军军官学校。
穿堂大厅及月台层，除了醒目的内嵌橘色壁灯，天花板则是浅蓝灰色的小方格为装饰，主要的纵轴线，则是长方形交错的吊板。