1949年国民政府迁台後，改隶台湾省教育厅，更名为「台湾省立博物馆」，期间经历1961年、1994年两次闭馆大修。1999年行政院文化建设委员会（简称文建会）改隶更名为「国立台湾博物馆」。由於该馆坐落於清代台北城东西主轴与南北次轴交叉点，建筑风格典雅庄严，成为台北市重要的历史地标之一，1998年经内政部评定为「国定古蹟」。
开馆初期约有一万多件典藏品，为当时总督府在台湾最具有代表性的博物馆。现今典藏与展示之内容多元，包含台湾人文史料与自然产物，并收藏了台湾的农业、水产、林产、工艺、贸易等资料，也保存了近4万件的标本。
行政体制上，设有人类学、地学、动物学、植物学及推广组等5个研究组，不断蒐藏、研究台湾本土的文化历史、生物物种及自然现象，并经常将成果透过主题展示、教育活动、出版及各项合作计画等方式呈现与延伸，以达到博物馆教育的目标。藉由典藏品的展示与推广教育，参观者可以了解台湾的地质、人文、动物及植物发展的轨迹和面貌。
由於主体建筑年代久远，展示与收藏空间有限，另在台北市徐州路新建研究典藏大楼，於1994年启用，可容纳馆内数量庞大的收藏品，并做为行政研究之用，不对公众开放；在文建会的规画下，国立台湾博物馆於2008年完成初期扩建计画。
中文关键字： 台湾总督府 , 台湾省教育厅 , 国定古蹟
延伸阅读