2005年1月，以「全民写历史，创造大百科」为宗旨的「台湾大百科全书网站」成立，文建会与附属机构分别在全国各地成立编辑小组，规画知识架构、设置词条，并举办座谈会、研习会，邀请各界专业人士，以及全国民众参与撰写。拟定知识架构之学门包括：工艺、建筑、美术、民俗、考古、历史、民族人类、文学、音乐、戏剧、戏曲、舞蹈、动物、植物、地质共15类，词条1万5000多篇。
2007年3月底，已撰写并完成审查之词条10,648篇，图片8,929张；「台湾大百科全书网站」计有300多万人次上网，登录为会员人数5,500多人。其後文建会自网路版选出词条303篇，编为《台湾大百科全书?网路精选版》一书出版。
2007年4月，文建会委托「台湾二十一世纪议程协会」将「台湾大百科全书网站」改版为大众版，正式上线，采web 2.0精神，全面开放网友以共建共享的方式编辑、撰写词条。所有文字资讯、图像等改采GNU自由文档许可协议授权，但文建会已建置之词条，仍保留原作者之着作权。大众版维运不久，因故终止。
在网路版编纂期间，各界对於执行方式、预期结果有不同之见解，2006年3月，文建会举行谘询会议，与会学者专家建议《台湾大百科全书》於「网路版」之外增编「专业版」，以扩大学者专家的参与深度，让网路、专业二版并行；同时规画专业版为18卷，包括：历史、地理、宗教民俗、文学、地球科学、艺术文化、政治法律、社会、经济、民族、教育、传播、观光休闲、医学、基础科学、环境科学、工程技术、生命科学，以及附卷地图、索引2卷。12月，文建会推动「台湾大百科全书专业版编撰计画」，以公开招标方式，委由智慧藏学习科技公司承办。
2007年2月，专业版之专案办公室成立，由远流出版公司董事长王荣文担任计画主持人，聘请中央研究院长李远哲为总监修长、中研院院士曾志朗为总编辑（任期为2007.1.1-2008.5.19）、Pchome创办人詹宏志为编辑总顾问；曹永和院士、李亦园院士、李太枫院士、王秋原教授为学门监修；王秋桂教授、黄光男教授、陈郁秀教授、王鑫教授、陈万益教授为学术主编；同时分别成立历史卷、地理卷、宗教民俗卷、文学卷、艺术文化卷、地球科学卷之编审委员会与编辑部，拟定知识架构与词条、建立编纂体例，进行邀稿；专案办公室分别於5月、11月组成编纂团队，参访《中国大百科全书》、《加拿大百科全书》、《大英百科全书》、《芝加哥百科全书》之总部，进行百科编纂经验交流。
2008年2月，专案办公室於「台北国际书展」期间举办国内首次百科全书国际研讨会，《大英百科全书》总编辑何得乐（Dale Hoiberg）、《芝加哥百科全书》计画主持人James Grossman应邀发表专题演讲。6月，各卷展开学术审查，同时进行通审通读；12月，6卷编纂完成，总计词条2,700条，字数2,43万字，图片1,500张；动员国内外之学者包括编审委员72人、学术审查141人、撰稿学者557人。
2009年9月，文建会汇整网路版与专案版之文字、图像内容，重新建置「台湾大百科全书」网站；自11月网站正式公开营运之一年内，将陆续推出3万个词条清单，邀请大众参与撰写，所有文字资讯、图像采「创用CC」之「姓名标示-非商业性-相同方式分享」（by-nc-sa）授权，以期全民创作、全民分享。
中文关键字： 文建会 , 大众版 , 专业版 , 网路版
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