- 《澎湖纪略》
- 《重修台湾省通志》
- 《台湾通史》
- 《台湾通志》
- 《澎湖厅志》
- 〈清初旅台学人着作之评介〉，《台湾文献》
- 澎湖时报 http://www.penghutime.com.tw/newsdata.php?no=09040349
高中举人後，周于仁前往福建省永春县担任知县一职。在政事上，除了展现治理能力外，也颇能处理地方防卫军事。雍正11年（1733年）8月，约60岁的周于仁因为政绩颇丰，被清朝政府拔擢为澎湖通判一职，从福建前往澎湖驻守。
进驻澎湖後，因为喜好澎湖人文风景，而有「才到澎湖便是仙」的感言。积极任事的他，因为看到驻守澎湖的闽兵恃骄强悍，欺凌地方族社。为此，他强加干预，凡是不法的人，全部将其绳之以法，此举获得澎湖住民赞赏。雍正13年（1735年）周于仁奉令清查澎湖地亩。於清查中，通判劝导移民开垦澎湖荒地，凡支持者，皆由官方资助种田牛只与农耕工具。同年8月，虽轮调时间届满，仍於澎湖以协办参与政事。翌年（乾隆元年；1736年）6月，则因病告假回四川原籍。返渡後，澎湖人感念恩德，於当地建立生祠来祭祀。
除了政事卓着外，周于仁最大贡献是编着廿篇、约三万字的《澎湖志略》。
1736年完成的《澎湖志略》，为清朝第一本专门记载澎湖的方志。後来於1740年，成为胡格编撰同名志略的原本。《澎湖志略》1卷20篇；主要记载澎湖成为清朝版图後之功绩，共分成舆图、海道、沿革、疆域、城垣、里程、宫庙、户口钱粮、仓储、科名、物产、舟楫、泊岸、渔舟、风俗、文员、武员、烟墩炮台、诗及赋等。志略中，最具代表周于仁个人的诗赋为《别澎湖十六韵》。诗文全文为：行年将六十，三仕到澎阳。海国东南峤，星经牛女乡。天悬青共远，水接碧同长。飓发疑雷吼，沙飞似雾茫。有时奔万马，无计卧双樯。风景虽多别，民情却甚良。勤耕蓣作饭，俭用布为裳。麦稻还须籴，豆麻尚可粮。黍黄村火密，草绿讼庭荒。柴户何尝闭，蒲鞭不用扬。官闲惟啸月，民乐可烹羊。窃禄亦云久，留名敢谓芳。光阴飞石火，花甲变星霜。将别还延伫，思归欲束装。群黎虽祖饯，一苇早轻杭。暂息鹭州地，追怀赋短章。
根据学者研析认为，《澎湖志略》开启往後200多年各种撰写澎湖历史的基本底稿；例如：1769年，胡建伟《澎湖纪略》、1893年林豪纂修之《澎湖厅志稿》。
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