由于蒙古科尔沁部归附后金最早，因此博尔济吉特氏与爱新觉罗氏世为懿亲。清太祖、太宗、世祖和圣祖先后有四后、十三妃出自科尔沁等部。皇太极的女儿中，有四位下嫁到科尔沁部。科尔沁的王公台吉，为满洲额驸者多达十三人。
根据史籍记载，清太宗皇太极有名号的后妃共有十五人，在这十五位后妃中，有七位来自蒙古草原。而地位最为尊贵的“崇德五宫后妃”，全部是蒙古族女子，更有三位出自科尔沁部。
科尔沁部左翼首领、明安贝勒之兄莽古思于公元1614年将女儿送与皇太极为妻，这就是皇太极的中宫皇后孝端文皇后，也称为哲哲皇后。
天聪三年十月，皇太极起兵征明，科尔沁部二十三位贝勒率领部众追随，为击败明军立下战功;天聪五年，科尔沁部随皇太极攻打大凌河，大败明将祖大寿。满蒙军事联盟不断加强，而与此相伴随的是满蒙贵族更为频繁地缔结婚约。
天命十年，科尔沁贝勒宰桑之子吴克善送妹与皇太极为妃，此女即庄妃。宰桑贝勒是莽古思之子、中宫皇后的兄弟，因此庄妃是皇太极中宫皇后的亲侄女。
天聪八年，吴克善又送一妹至沈阳与皇太极为妃，这次送来的是庄妃的胞姐海兰珠，被皇太极纳为宸妃。这样一来，形成了莽古思一门姑姑侄女三人同嫁一夫的局面。而这之后，皇太极将他与庄妃所生之女又回嫁给吴克善之子，这也是满族早期婚俗中不论辈分和近亲结婚的表现。
