最让雍正深感忌讳的是，皇九子胤禟曾派外国人穆景远拉拢年羹尧，穆景远对年羹尧说：“九阿哥貌似有福之人，将来很有可能会被立为皇太子。”年羹尧并不为所动，可这一场景却被雍正深深地记在了心上。此后胤禟被软禁在西北交给年羹尧管理，年羹尧上奏说胤禟“颇知收敛”，这明里已经给胤禟说好话了，雍正不以为然地批驳说，胤禟是奸宄叵测之人，继续提防才行。可见在整治胤禩、胤禟这件事上，雍正、年羹尧是有一定分歧的。
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要说年羹尧拥戴雍正即位这点上应该没有太多的疑问，主仆关系尽管不很密切可也休戚相关，胤禵从西北回来，年羹尧一个人受命于危难之间，用了短短的几个月时间平定了罗布藏丹津的叛乱，给雍正挣足了脸面。但是，年羹尧诚心诚意拥护雍正与坚定支持他用激烈的手段对付胤禩、胤禟乃至胤禵又是另外一码事。年羹尧就近监视胤禟，自然和胤禟少不了打交道，加之以前的渊源，胤禟为何许人，年羹尧当然清楚。在年羹尧看来，胤禟此人并无才具，不值得下大力气提防，而且，胤禟就算是不服雍正，可也没有到了公开造反、挑动闹事的地步。胤禟在西北和亲信穆景远说过这样一件事：“有人给我送来一个帖子，上面有山陕百姓说我好，又听见我很苦的话。我看了帖子，随着人送还了，向那人说，我们兄弟没有争天下的道理，此后要再说这话，我就叫人拿了。”《文献丛编》第一辑《允禩允禟案·穆景远口供》。
有人出面鼓动胤禟硬性对抗雍正，胤禟不同意，他的态度是他尽管不服乃兄，可这也是兄弟间的家务，不能走到争天下的地步。这说明胤禟此人虽然才能平平，可脑筋并不糊涂，而且也不准备采取什么极端的手段进行报复。年羹尧对这些情况、包括在西北的一些之于胤禟的总体印象，他不可能不了解，而且，他比雍正了解得更为直接。按照年羹尧对胤禟的观察，他认为像胤禟这样的人物虽有怨气，但只要看管得当，出不了大的纰漏，没必要对其赶尽杀绝。年羹尧的这种念头导致他在胤禟、胤禩问题上的含糊不清，这就给雍正造成一个错觉，感到年羹尧不再像以往那样俯首帖耳、唯命是从了。如果是其他人这么做，雍正倒也不用过多地担忧，唯独年羹尧、隆科多这样重量级的人物假如有了类似的想法，那就比较麻烦。
