首先确定榜单构成。榜单包含一个综合榜单和六个分榜单，将全国共计1200余家三甲医院，按照指标体系不同权重计算得到全国三甲医院排名前100，六个分榜单分别计算专利申请量、专利授权量、发明专利申请量、发明专利授权量、PCT申请量、专利转化量得到全国三甲医院排名前50。
其次是榜单的评定。榜单的评定过程共分为数据调研、数据核实和数据分析三个阶段。数据调研阶段重点参考了incoPat专利数据库的数据，并走访了大量医院。数据核实阶段针对前期从各种渠道收集的数据与医院逐一核对，确保数据不出现任何差错。数据分析阶段则按照预先制定的评价体系进行数据分析、计算，得出最终排名。
为保证评价指标的科学性和准确性，评定期间还首先通过德尔菲法调研确定指标设置和准确定义，然后采用层次分析法确定指标权重，最后对指标值进行标准化处理，最终计算得出每家医院的综合得分。
最后是榜单数据的保障。榜单的基础数据来自行业认可的公开专利数据库，并经过多轮清洗核对保障准确性；同时抽取50家上榜医院数据进行逐一比对，针对医院反馈的问题进行分析解答，核实确认和补充医院提交的数据。
葛均波院士表示，去年榜单的发布为行业提供了很多有价值的信息：
全国三甲医院专利成果储备量丰富，2021全国三甲医院专利申请量已达到近7万件（共69278件），吉林大学医院的专利申请量达到1200件；2021年全国三甲医院专利授权总量共8万余件（81060件），华中科技大学同济医学院附属协和医院专利授权量达到1393件。
发明专利在医院创新中备受重视，医院专利质量逐渐提升，2021年全国三甲医院发明专利申请量近2万件（共19117件），四川大学华西医院发明专利申请量达到603件；发明专利授权量共6296件，青岛大学附属医院发明专利授权量为375件。
医院专利转化量创新高，2021年全国三甲医院专利转化量共1002件，较上一年同比增长近2倍，上海交通大学医学院附属第九人民医院专利转化量达到91件。转化专利中发明专利约占一半，类型上以器械为主，占80%以上。
这些信息为未来持续推进医学创新成果转化和国内医学创新事业发展都提供了有针对性的指引。
三、突破重重困难
终成行业创新风向标
首届榜单的评定和发布并非一帆风顺。葛均波院士回忆说，在去年榜单的整个评定过程中，特别是数据核实过程中，遇到了各种各样的困难，同时也暴露出了目前医院专利管理体系中的一些问题。
首先在专利管理方面，很多医院刚刚开始重视，尚没有建立比较完善的数据管理台账。工作人员在数据核对时，每一件专利需一一核对，确定专利数据的真实性。
其次是在医院之间、地区主管机构之间，尚没有统一的管理标准。“比如医院在统计自家的专利转化数据时，一些将权利变更作为已转化，一些将合同签署作为已转化，针对这种情况，必须将每个转化事项从合同文本、公示信息、到账情况和权利变更情况等逐个核实，保障数据的准确性。”
同时，很多医院同样存在权属不清楚或者杂糅的情况。一些大学附属医院，或医院附属研究机构，专利所有权归属不统一，有些已经转让的专利，仍存在所有权在医院的情况，针对这些情况，榜单评定团队做了很多查缺补漏的工作，保证榜单的公平性。
在各方力量的共同努力下，尤其是医学创新领域广泛的支持与认可。先后有数十家医院转发榜单并发布了与榜单相关新闻。众多上榜医院都将登上榜单作为年度医学创新转化工作的重要成绩写入年终总结报告。
人民日报等30多家主流媒体和门户网站以及行业媒体、自媒体在榜单发布进行了及时报道。
榜单的发布初步达到了：形成价值导向、反映整体现状、树立行业标杆、促进整体提升的基本目标。为达成行业共识，引导医学创新转化发挥了应有的作用，成为国内医学创新风向标。
谈及克服各种困难，完成榜单评定、发布并最终获得广泛认可的过程，葛均波院士对团队的高度肯定溢于言表，并对在整个过程中给予支持的政府机关、医院和领导专家以及同行表示衷心感谢。
