清朝建立之后，为了缓和满汉矛盾，基本沿用了明朝的制度，地方上由满人掌印，汉人办事。本来清朝权利最大的权利机关是议政王大臣会议，国家大事由议政的王和大臣共同商量，这就又威胁到了皇权，于是康熙皇帝设置南书房，相当于自己秘书班子，直接架空了议政王大臣会议；雍正更是设立军机处，军机处相当于皇帝的秘书班子，直接凌驾于六部之上，等于所有的权利都归了皇帝一人，皇权专制达到顶峰。
明清时代，为了对全民进行控制，建立了大量的特务组织，明朝有东西厂和锦衣卫，清朝有粘杆处，一举一动均在监视之下，使人民活在恐惧当中。
明朝特务剧照
明清时期还大兴文字狱，对人民进行思想控制，凡是对皇家不利的言论都要问责到底，制造了大量的冤案，那是的人民活在极度的恐惧当中，你想研究物理化学吧，对不起，高考不考，没前途；研究文科类的又怕犯禁，最后只能像鲁迅的小说《孔乙己》里边讲的一样，“茴香豆的茴字有四种写法”。乾隆年间对民间的图书进行整理，编撰了《四库全书》，销毁所谓的“非法”图书，其实就是一场文化浩劫。
回顾中国古代的政治制度核心就是为加强皇权，不仅在制度上保证，还要进行思想控制以及采取特务组织进行监视，这种情况一直持续到庚子国变，慈禧回銮，开始实行晚清新政时期才有所放开，但紧接着是连年不断的战争，直到新中国建立，中国才有了一套完善的中央集权的政治制度。
