关于顺治皇帝临终传位问题，直到现在还被人们质疑，从记载中可以看出，康熙帝玄烨在顺治生前并不受宠。而最让人信服的无非就是玄烨曾经出过天花，而得以继承皇位。
然而分析顺治和孝庄太后的母子关系却不难发现，这对母子在感情上不甚和睦，顺治处处受到母后孝庄的牵制，作为20多岁的皇帝，天生叛逆也情有可原。关于顺治帝嗣君的选定，魏特在《汤若望传》中披露一些内幕。
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书中称道：顺治帝在病重期间，没有立诏传位皇子，而是想从他的兄弟中选择一位继承。皇帝询问汤若望等人的意见，汤若望完全站在了孝庄太后的一边，支持皇太后所选的皇子作为继承人，于是顺治帝才决定玄烨为帝位继承人，促成这个决断的理由就是这位年幼的皇子已经出过天花，今后不会再受到这种病症的伤害。而那些年龄较长的皇子，尚未出过天花，时时得小心这种可怕恐怖的病症。
记载中谈到了顺治先是选中了一位“从兄弟”，当时还在世的“从兄弟”有四位，分别是辅国公叶布舒(兄)、镇国公高塞(兄)、辅国公常舒(兄)和辅国公韬塞(弟)，虽然不知顺治到底选中了那一位，但很明显，这四位都是满籍妃嫔所生，没有一人出自蒙古的博尔济吉特氏。
顺治这种做法很明显违背了“子承父继”的祖制，他自己继位的时候应该最有体会，倘若不是这个祖制的约束，他的皇位可能就是多尔衮的。明知如此，顺治帝还有意为之，显然是用意的。
这种立兄弟为嗣的做法孝庄太后是绝对不会允许的，她不仅在儿子病危时“力促”选立嗣君，而且召集亲王们共同推翻皇帝的成命，力主在皇子中选立新帝。
关于母子之间议立新帝的分歧经过，比较合理的解释是，顺治帝初二卧病不起，自知不久于人世，便召见王熙议立继位之君等事。他即与母后有隙，于是提出了“从兄弟”即位作为报复和最后的抗争，并写有“密封奏折”。
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王熙不过是一介小小汉官，怎敢在如此重大事情上擅自隐讳，便向孝庄太后如实禀告。太后闻讯后五内俱焚，立即召集诸亲王会议，坚决反对顺治皇帝的成命。
顺治帝共有八子，其中四个早夭，当时除了玄烨外尚有福全、常宁和隆禧，俱非蒙古妃子所生。孝庄皇太后因皇后无子(顺治皇后是孝庄侄女博尔济吉特氏)，只能从帝业稳定的角度考虑，提出让已经出过天花的玄烨即位。
面对母后的建议，顺治无奈，只得勉强答应，也可能最终双方未达成协议，但是他已经黄泉路近，紧接着便出现了孝庄太后私改遗诏之事。
初六日，大学士王熙再次被召入宫，顺治帝自觉病势沉重，恐再难支，他强撑病体，对王熙嘱道：“朕患痘，势将不起，尔可详听朕言，速撰诏书，即就榻前书写。”
王熙闻言泪流满面，泣不成声，顺治帝催促道：“朕平日待尔如何，训尔如何详切，今事已至此，皆有定数。君臣遇见合，缘尽则离，尔不必如此悲痛。此何时，尚可迁延从事，致误大事?”顺治帝直到临终还是想把皇位传给他的兄弟。
王熙只得拭泪吞声，在御榻前执笔撰诏，但他心中暗暗叫苦，未曾料到顺治皇帝特令“就榻前书写”，一刻不离，这着实难办。
原来被顺治帝视为心腹的王熙，早已置于孝庄太后的控制之下，他与皇帝的所有言谈举止，太后悉之无遗。此刻的王熙即知道顺治帝的秉性固执，更惧怕太后的权势威严，而遗诏一经拟定盖上玉玺，就很难更改一字，那么在孝庄太后面前他也无法交代。
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想到这儿，王熙进退维谷，左右思量，当写完第一段遗诏之后，他发现顺治已倦容满面，不由心生一计，忙奏道：“恐过劳圣体，容臣奉过面谕(让顺治口授之后再撰写)，详细拟就进呈。”顺治帝已经气息奄奄，再无精力去想王熙此话背后的真实意图，便将遗诏大意说明，王熙忙卷起诏书，退出寝宫，方才脱身。
王熙连夜拟诏，反复修改到第二天中午才算定稿。然后交给顺治帝御览，可是此时的顺治帝已经丝毫没有精力细看，当天夜里顺治帝便去世了。
孝庄太后从容不迫的按照自己的意思修改遗诏，玄烨最终登基即位完全是孝庄太后的功劳。
不过这段历史也只是很多学者的推断，但玄烨即位的结果是好的，孝庄此举不但成就了一位明君帝王，更是成就了一番祖孙千古佳话。
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