由于财政短缺，政府为解决辽东战场与后金战争的经费，遂加征“辽饷”;
由于辽东战场开支形同无底洞，政府开始人员收缩，对官办驿站进行裁撤，导致被裁员的驿站工作人员加入流寇队伍，故朝廷不得不在“辽饷”之外，加征“剿饷”，剿除匪寇专用;
由于征收“剿饷”加重人民负担，民怨达到顶点，把更多人推向起义军的队伍，“匪寇”越来越多，剿匪随之需要越来越多的士兵，于是朝廷开征“练饷”，专门用于练兵。
如此，偌大的帝国左支右绌，头痛医头，脚痛医脚，根本无力走出死循环。
4
到了陕西以后，孙传庭显然已看出“崇祯死局”是个死结，如果继续加饷—养兵—剿匪的套路，只会死得更快。
他采取的是另一套做法：挑战潜规则。尽量不加重百姓负担，而寻求向富户豪门下手。
按照制度，明朝的卫所均实行军屯制，但到了明末，屯田已被权贵侵蚀殆尽，而士兵则只是花名册上吃空饷的一个个名字而已。
孙传庭不是第一个发现问题所在的人，但他是第一个发现问题而不装睡的人。
他贴出告示，要求豪强权贵交出多占的屯田，“地不容失一亩，粮不容遗一粒”，拒不执行，则直接枭首示众。
据说，占屯田、吃空饷已从潜规则，变成了明规则，人人皆知，而人人见怪不怪。当地权贵面对孙传庭的来势汹汹，自信人性自有弱点：只要他是个人，不是机器人，就能花钱搞定，10万不够就100万，100万不够就1000万。
他们此前或许已经搞定了无数巡抚，但没想到孙传庭是特殊材料制成的。
权贵富户被孙传庭收拾得很惨，他们对孙传庭恨之入骨，以后则反扑过来加速了孙传庭悲剧的诞生。
孙传庭依靠清屯，最终养成了一支精锐的秦军。
他对自己的经验颇为自得，给崇祯上疏说，以后陕西剿匪、练兵，不必仰求国家财政部接济了。他是想让皇帝明白，打破潜规则，从权贵手中清屯，才能解开帝国沉沦的死循环。
但崇祯对比了加征剿饷和清屯的效率，还是倾向于来钱更快、更简单的加征剿饷。所以只是下旨奖赏了孙传庭，而未采纳他的做法。
孙传庭无奈。
5
孙传庭还来不及叹息，战争已经让他一战成名。
当时，朝廷任洪承畴为三边总督，专剿潼关内的义军;任卢象升为五省总理，专攻潼关外的义军。孙传庭的任务，是协助这两人作战。
洪承畴和卢象升，都是帝国最有名的武将。洪承畴手中的秦军，卢象升创立的天雄军，与正在抵抗后金的关宁铁骑齐名，均是明朝的主力部队。
即便如此，洪、卢两人都承认，并未能重创“闯王”高迎祥的义军。
孙传庭的秦军练成后，设计引诱高迎祥深入关中，在著名的黑水峪(今陕西周至县黑河水库)之战中，活捉了高迎祥等义军主要将领。
高迎祥等人被押往北京，凌迟处死。
孙传庭一战成名。
随后，他连续剿灭了几股重要的义军势力。一时间，他的威名几乎盖过洪承畴了。
义军在陕西遭到强力阻击，遂大部转移到河南发展。崇祯十一年(1638年)，孙传庭奉命出征，过天星、混天星、大天王等几股义军势力兵败投降。
此时，遭到洪承畴追堵的李自成部，势孤失援。
传说，洪承畴与孙传庭合力，打得李自成仅剩十八骑突围而走，几乎全军覆灭。
十八骑的说法可能有些夸张，但李自成部被打得七零八落，则是事实。加上此时张献忠、罗汝才等义军首领都投降了朝廷，明末农民起义走到了最低潮的时期。
于是，帝国中枢认为内乱已经平定，朝中要员纷纷庆贺“天下无贼”。这为崇祯误判形势营造了氛围。
长期以来，明朝都在攘外和安内孰先孰后的问题上摇摆。最终，崇祯听从了兵部尚书杨嗣昌的建议，“攘外必先安内”，向清军释放缓和气氛，全力对付内乱。
听到李自成大败、张献忠投降的消息，崇祯断定内乱已平。加上清军放言将要南下，崇祯决定由“安内”转向“攘外”，下令洪承畴、孙传庭入卫京师。在此之前，卢象升也已从剿寇主战场退出，被任命为宣大总督，抵御满洲铁骑。
崇祯朝最后一次重大国策调整，悄然完成。但这次调整，埋下了四五年后明朝“亡于内，而非亡于外”的伏笔。
明末清初史学家吴修龄说：
京城有警，洪公(洪承畴)、孙公(孙传庭)一去一留，及为正计，而齐撤之以开贼生路。
这个判断无疑是正确的，如果调洪承畴入卫，而留孙传庭继续剿寇，明朝的历史极有可能被彻底改写。但现实却是，崇祯把帝国最猛的将领和部队，通通投入攘外，使得中原出现了剿寇的兵力空虚地带，义军很快“春风吹又生”，卷土重来。
《明史》记载，洪承畴、孙传庭离去后，李自成“稍得安”。
李自成获得喘息机会，借用河南大饥荒的机遇，以“迎闯王，不纳粮”相号召，在河南重新聚拢起庞大的队伍。这次，明朝没有机会了。
更可悲的是，入卫不久，孙传庭蒙冤，竟被投入监狱。
帝国无人可用，而名将在牢里。
6
关于孙传庭入狱的原因，已很难清晰呈现。但离不开这几个基本因素：陕西权贵的诬告，朝廷高层的内斗，以及崇祯的刚愎自用。
孙传庭曾说：“臣以痴忠，取忌当路者甚众。”因为真心为国尽忠，他得罪了太多人，隐约有不祥的预感。
孙传庭为人直率，他对当时的国策和朝政很不满，所以一直在上疏请求面见崇祯。在奏疏中，他直言：
今日之事，臣不能，谁为能者?臣不任，谁肯任者?……独是向来悠悠忽玩，夸张诞妄，虚廿余年岁月，糜几万万金钱，而秋毫罔绩，遗忧君父者何人?
