几个月后，当年羹尧案已经做实后，雍正在查弼那的奏折批示说：“参年羹尧的已经够了，不敢说隆科多一句，朕实叹息，且对尔等钢铁般的伙党，朕真的害怕心服了。”几次拉锯后，把查弼那折磨的回奏说：“臣上奏七次，不能合皇帝天心，臣已无活路，现在再不讲隆科多的劣行，臣性命不保。”但他又说：“众人所知，臣知;众人不知，臣也不知。”
年羹尧(1679年—1726年)_图
在赐死年羹尧后，雍正开始着手解决舅舅隆科多“问题”。
雍正在处理隆科多问题上采取了高超的政治手段，把他派到阿尔泰岭，与策妄阿拉布坦议定准格尔与喀尔喀边界，之后安排到俄罗斯进行边界划定谈判。隆科多刚走，雍正召开高层会议，对隆科多问题进行定调：“隆科多有种种罪恶，应置重典，如果此次他能实心任事，朕必宽宥其罪;如果心怀叵测，朕必将他治罪。”
此后在雍正十三弟允祥率先发力弹劾隆科多受贿，最后坐实四十多项罪名，曾经深得康熙重视的又是新皇帝雍正舅舅的隆科多，因一念之间，便最后落得圈禁而死，很大程度上也被视为雍正全面清算当初在储位之争的历史问题。
