乾道元年(1165年)，杨存中班师，朝廷加他为昭庆军节度使，再次奉祠。当时兴起屯田，杨存中将自己在楚州的私田三万九千亩献出。乾道二年(1166年)，杨存中去世，时年六十五岁。以太师身份退休，被追封为和王，谥号“武恭”。宋高宗追念以前的臣僚，为他流泪，赠钱十万。宋高宗依靠诸将，对杨存中眷顾尤其深厚，曾经说：“我对杨存中，抚绥胜过对我的子弟。”濠、庐之战，亲笔告诫他说：“如不前进，当以军-处。”赵密代替他统帅殿前司，就例举唐朝崔佑甫夺取王驾鹤兵权事，预戒大臣。等到事毕后，又说：“杨存中被罢免，我三天夜晚睡不安寝。”
