然则传位夺嫡之说，或因雍正推行摊丁入亩、官绅一体当差纳粮之新政、打击贪腐权贵、重用张廷玉、李卫、田文镜等汉人，而引来失势满人权贵之蓄意诬陷。康熙皇帝岂能将九门提督授予不可信赖之人任之，又岂会不知隆科多与雍正之关系而造成众皇子传位纷争？由此而论，康熙让隆科多任九门提督，正是意欲传位于雍亲王，并加以保护的实证之一。
征兆一：“康熙六十年正月，命皇四子雍亲王胤禛、皇十二子贝子胤祹、世子弘晟以御极六十年，告祭永陵、福陵、昭陵。”康熙登基一甲子六十年之重大祭告先祖非同一般，派遣雍亲王胤禛主持，岂能不具备重大意义？为何不是派遣支持皇十四子胤禵、皇八子胤禩、皇九子胤禟、皇十子胤?或是皇三子胤祉
征兆二：康熙御极六十年派雍亲王胤禛祭祖此举，让废太子胤礽之师王掞看出端倪，故于三月“大学士王掞密奏请建储，至是监察御史陶彝、任坪、范长发等人曾疏请建储，帝不悦，并掞切责之。诸王、大臣奏请治大学士王掞罪，帝赦不治。”这亦可视为康熙安排接班人的部署迹象之一，毕竟皇十四子胤祯尚且领兵在西北，一旦提早公布，易生事端。
征兆三：“五月壬戌，命抚远大将军胤祯移驻甘州。以年羹尧总督四川陕西，色尔图署四川巡抚。”康熙以皇四子雍亲王胤禛之亲信年羹尧箝制皇十四子胤禵的军后补给已然成形。
征兆四：康熙六十一年四月，“命抚远大将军胤祯复往军前。十月，命雍亲王胤禛率弘昇、延信、孙渣济、隆科多、查弼纳、吴尔台察阅京师通州仓廒。”康熙指示由雍亲王胤禛亲率隆科多、查弼纳等众多京师王公重臣，竟然只为“察阅京师通州仓廒”，已有不寻常迹象。
征兆五：“十一月帝不豫，驻跸畅春园。命皇四子胤禛恭代祀天。”康熙驾崩前祀天仍然未派皇三子胤祉、皇八子胤禩、皇九子胤禟、皇十子胤?代祀，更未召皇十四子胤禵返京，此时康熙意欲传位于雍亲王皇四子胤禛已然十分明显。
曾在故宫博物院展出的康熙皇帝遗诏上并无“传位于四皇子胤禛”，而是写着：
为政举措
科学
一些近代史家认为清朝中后期国力开始远远落后于西方，康熙晚年的墨守成规，缺乏创新，有着不可推卸的责任。 英国籍史学家史景迁批评康熙有三：一是皇位继位的纠葛进退失据；二是康熙虽喜爱西学，任用耶稣会士，并允传教，但对西方并不信任，因而有礼仪之争以及导致雍正禁教；三是康熙以轻徭薄赋自豪，以此彰显盛世，但其永不加赋的政策按耕地面积缴固定税金，与人口无关，于是人口虽增，亦不加赋，为康熙的继承者造成财政困难。
亦有史学家指出，康熙会欣赏和重用有才华的传教士，西方先进的科学技术也被推崇和应用。而在民间，民人与西方传教士能够互相交游，西学在社会中得以自由传播，亦指出分别由康乾皇帝敕辑的丛书－《古今图书集成》和《四库全书》亦收录了传入中国的西方科学技术 。
康熙除了学习西方科技之外还会应用实践，其最突出的成就，就是在发现原来的地图绘制方法相对落后之后，用科学方法和西方仪器绘制全国地图。康熙亦会利用巡行和出兵之便，实地测量，吸取经验。在康熙四十六年(1707年)委任耶稣会士雷孝思、白晋、社德美及中国学者何国楝、明安图等人走遍各省，运用当时最先进的经纬图法、三角测量法、梯形投影技术等在全国大规模实地测量，并于康熙五十七年(1718年)绘制成《康熙皇舆全览图》，其作被称为在当时世界地理学的最高成就，英国李约瑟亦称之为不但是亚洲当时所有的地图中最好的一幅，而且比当时的所有欧洲地图都要好、更精确 。
康熙还以巡视之便访求民间的有才之士，例如将在数学方面有很大成就的梅毂成调进宫中培养深造 。梅毂成亦通过学习西方数学知识，重新令在明朝被废弃的中国古代数学受到重视 。
康熙亦曾经委派传教士闵明我（Domingo Fernández Navarrete）返回欧洲招募人才，希望增进中西方科技文化交流 。
康熙是中国历史上少有的重视自然科学的皇帝，自身具有相当高的科学素养，曾从南怀仁学习欧几里得几何学并且每天听讲。后来又学习西方的测量、天文、物理和医学等知识，并在宫中设置了研究化学和药学的实验室。康熙因南怀仁督造火炮方面的功绩，一直对他优礼有加，而南怀仁等西方传教士也促进了伽利略的弹道理论在中国的传播 。
康熙对理学名臣李光地、熊赐履等说：“汝等知西洋人渐渐作怪乎？将孔夫子亦骂了。予所以好待他者，不过是用其技艺耳。历算之学果然好。你们通是读书人，见外面地方官与知道理者，可俱道朕意。” ，有人认为他担心先进的西方科技一旦传开，将会极大的动摇以骑射起家的满清的统治 ，亦认为此举导致中国对于火器研发因此倒退。据传教士张诚（J. F. Gerbillon）的日记记载，康熙为了保护传教士不被其他官员陷害而不准他们在有汉人和蒙古人的衙门里翻译任何科学文献。18世纪康熙末期，因罗马教廷发出禁止中国人教徒祭祖的禁令而引发礼仪之争，促使清廷反制并下令“自今以后，若不遵利玛窦规矩，断不准在中国住，必逐回去” 。
军事
康熙年间，由于平定三藩之乱以及抵御外来侵略的需要大量制造火器，无论是造炮规模、数量、种类，还是火炮的性能和制造技术，都达到了前所未有的水平。同时，大清政府所造的大小铜、铁炮达905门之多，而其中半数以上由南怀仁负责设计监造，就质量而言，其“工艺之精湛，造型之美观，炮体之坚固，均为后朝所莫及” 。
海外贸易
康熙初年实行了迁界禁海政策，规定沿海30里的居民内迁，片板不准下水。先是在福建沿海实行，后又推广到广东和浙江沿海。清政府划定濒海范围（从最初的濒海三十里左右，到后来的四十里、五十里、乃至到二三百里不等），设立界碑，乃至修建界墙，强制处在该范围内的沿海居民迁移，并对拒绝执行或越界者进行残酷镇压。这一政策令距离海边三十里到二三百里不等的整个中国东南沿海地区成为无人区，所造成的破坏和后遗症远远超过一次大规模的战争。
