与台湾近代医学发展密切相关的堀内雄次(曾担任台湾总督府台北医学专门学校校长,并致力於台湾的医学教育发展,以及推广公共卫生相关事务),即为小田俊郎的岳父。
1922年到北海道大学赴任,参与医学部创设,1925年赴德国留学2年,後於1934年被任命为北海道大学教授,同年以台湾总督府医院院长,兼任台湾医学专门学校教授身份到台湾赴任。来台後担任台北帝国大学医学部准备委员。
台北帝国大学於1936年创设医学部後,小田担任内科教授,1938年台北医院正式移交为台北帝国大学附属医院,小田俊郎被任命为第一任院长(1938.04~1940.09)。1942年就任为台北帝国大学医学部部长(至1945年为止)。
台北帝国大学医学部以风土病、肺结核、消化系统疾病为研究发展的三个主要题目,并以此规划内科学讲座,聘请三位内科教授分别主掌。第一内科最早设立(1937年),小田俊郎担任当时的第一内科讲座主任,研究主题为热带地方的各种传染病(尤其是疟疾、伤寒)、过敏症、心脏血管疾病。日後台湾内科名医陈万裕,即在小田俊郎的所领导的第一内科讲座以研究〈热带地区各种疾病之凝血酶元研究〉获得了医学之博士学位。
第二次世界大战於1945年结束,台北帝国大学改为国立台湾大学,小田俊郎被延聘为教授,至1947年返回日本。
小田俊郎返日後,蒐集日本在台统治五十年发展医学及医学教育的相关资料,并从其岳父堀内次雄处取得了许多重要的资料,後整理出版为《台湾医学五十年》。除了医学着作以外,小田俊郎也出版了几册随笔集,许多随笔则刊载於《日本医事新报》等多种医学杂志。
参考资料