1、季骐光?? 康熙二十三年由闽清知县调任(1684)，康熙二十四年以忧去(1685)??
2、樊维屏?? 康熙二十五年任(1686)，康熙二十七年以劾去(1688)? ?
3、朱道中?? 康熙二十八年任(1689)，康熙二十八年卒於任(1689)??
4、张〔王尹〕? 康熙二十九年任(1690)，康熙三十三年陞任河南彰德府同知(1694)??
5、董之弼?? 康熙三十四年由闽清知县调任，十二月十九日以前到任(1695)????
6、毛凤纶?? 康熙三十九年由建阳知县调任(1700)，康熙四十三年任满陞任江西7、吉安府同知(1704)??
8、宋永清?? 康熙四十三年秋以凤山知县署(1704)????
9、毛殿扬?? 康熙四十四年由诏安知县调任(1705)，未数月卒於任(1706)??
10、孙元衡?? 康熙四十五年以台防同知兼摄(1706)?????
11、李镛?? 康熙四十五年由宁洋知县调任(1706)?????
12、宋永清?? 康熙四十七年在任，以凤山知县兼署，康熙四十八年在任(1708)???
13、刘作楫?? 康熙四十八年由铨选任，康熙四十九年在任(1709)????
14、周元文?? 以台湾知府摄，康熙五十年在任(1711)??
15、刘宗枢?? 康熙五十一年由尤溪知县调任(1712)，以忧去(1714)??
16、周锺瑄?? 康熙五十三年由邵武知县调任(1714)，陞任去(1719)??
17、朱夔?? 康熙五十八年由南平知县调任(1719)，康熙六十年十二月十八日以朱一贵案正法(1722/2/3)??
18、汪绅文?? 康熙六十年由漳浦知县调署(1721)，康熙六十一年五月囘任漳浦知县(1722/6)??
19、孙鲁?? 康熙六十一年五月由署台防同知兼摄台湾知县调任(1722/6)，雍正四年陞任台湾知府(1722/6)??
20、刘良璧??? 雍正五年任(1727)，雍正八年卸调任龙溪知县(1730)??
21、冯尽善?? 雍正七年任(1729)，雍正九年任满(1731)??
22、姚孔鍼?? 雍正十年长乐知县调任(1732)????
23、陆鹤(陆鹏)?? 雍正十一年由连江知县调任(1733)，任满以母忧去(1723)??
24、戴大冕?? 乾隆元年任(1736)，乾隆三年陞任淡水同知(1738)??
25、何衢?? 乾隆四年任(1739)，乾隆七年三月在任?????
26、严暻?? 乾隆六年由海澄知县调任(1741)????
27、林菼?? 乾隆十年四月任(1745/5)，罢职去(1746/1)??
28、周缉敬?? 乾隆十年十二月由平和知县调任(1746/1)，乾隆十四年三月调署台湾知县(1749/5)??
29、周芬斗?? 乾隆十四年三月由平和知县调任(1749/5)?????
30、徐德峻?? 乾隆十六年十月由惠安知县调任(1751/12)，乾隆十九年二月初四日调赴京引见(1754/2/25)??
31、沈宗良?? 以万丹县丞署，乾隆十九年十一月在任(1754/12)???
32、辛竟可?? 乾隆二十年五月任(1755/6)??
33、嵇璇?? 以笨港县丞署，乾隆二十四年以前在任(1759)?? ??
34、李倓?? 乾隆二十二年七月任，乾隆二十五年十月在任(1757/8)?????
35、卫克堉?? 乾隆二十六年三月由永定知县调任(1761/4)，乾隆二十九年调任南平知县(1764)??
36、张所受?? 乾隆二十九年五月由诏安知县调任(1764/6)，乾隆三十二年闰七月初九日奉旨陞补北路理番同知(1767)??
37、陶浚?? 乾隆三十二年由诏安知县调任(1767)，乾隆三十四年四月二十三日奉旨革职发往伊犁效力赎罪(1769/5/28)??
38、曹永植?? 乾隆三十四年以笨港县丞署(1769)，乾隆三十五年被福建巡抚温福奏参昏愦溺职，六月初三日奉旨交部严察议奏(1770/7/24)??
39、周大本?? 乾隆三十四年由长泰知县调任(1769)，调任侯官知县(1773)??
40、陈松?? 乾隆三十八年任(1773)?????
41、李倓?? 乾隆四十一年任(1776)?????
42、杨慰?? 乾隆四十四年十一月由诏安知县调任(1779/12)，乾隆四十六年八月以参革去(1781/10)??
43、冷震金?? 乾隆四十六年任(1781)，乾隆四十八年正月十三日奉旨革职孥交刑部定拟具奏(1783/2/14)??
44、陈良翼?? 乾隆四十八年代理(1783)，选陞云南嵩明州知州(1785/10)??
45、唐镒?? 乾隆五十年九月以北路理番海防同知署(1785/10)，乾隆五十一年七月卸(1786/8)??
46、董启埏?? 以台防同知兼摄(乾隆五十一年闰七月在任)(1786)，乾隆五十一年十二月初六日诸罗城陷殉职(1787/1/24)??
47、黄嘉训?? 乾隆五十一年十二月以降调知县署(1787/2)??
48、谢本量?? 任期不详，资料未记载??
49、陈良翼? ?乾隆五十二年正月代理，十一月初二日以知州衔补授(1787/3)?
参考资料