透过水神共工叛乱一事，玉皇大帝发现神人混居令到地上的人类部落都拥有着强大的力量，虽然自己不在，但只是一个小小的水神共工就能把颛顼逼死，作为天地人三界最至高无上的他，绝对不能容许天界的权威受到威胁。于是他派自己的大儿子轩辕带着神通法力，转生到人世。
轩辕在人间的名字叫做黄帝，黄帝长大之后，顺理成章的成为中央一万二千里的大帝，娶了个老婆叫做雷祖。雷祖对穿着十分的讲究，设计出了很多款式的衣服给大家穿，因为有了雷祖，女人们不再穿得衣不蔽体，知其母而不知其父的情况也在这个时代渐渐被改变了。黄帝成为中央天帝之后，马上对百姓说了这么一段话：现在天下由五个大帝统治，我们中央这块地方整天受到来自四个方向的部落的欺负，守边疆的士兵们每天晚上连睡觉都要穿着甲胄准备随时打仗，这种状况不能再继续下去了!经过全民总动员，黄帝率领着大军横扫东西北三方，伏羲的退隐、祝融的内应加上颛顼部落的衰落，三个方向的强域很快便落入了黄帝的手中。于是黄帝把目标锁定在四方天帝中最强大的炎帝部落上。炎帝部落的人个个英勇善战，特别是其中的夸父族人，全部都是巨人，能够以一敌百，玉皇大帝当然不会让自己的儿子白白送死，于是派出几乎全数的天神参战，其中比较著名的有风伯雨师雷公电母等。黄帝发动突袭，炎帝部落的人哪里抵挡得住诸神的地水火风，一夜之间就败退了几千里，之后炎帝虽然亲自带队敌住黄帝的大军，黄帝手下尽是天兵天将，双方在实力上相差太远，炎帝最后退守不老山，郁郁而终。从此神州一统，黄帝成为第一个统一天下的人。因为炎帝以仁爱得天下，而黄帝是靠武力得天下，至今华夏子孙称自己为炎黄子孙的时候，都要把炎帝排在前头。
炎帝虽然死了，但要让他的子民听话可一点儿也不容易，而且黄帝的暴力手腕令到爱好和平的南方百姓十分的反感，这时候蚩尤出现了。蚩尤天生铜头铁额，牛首人身，四眼六手，本是炎帝的帐前的一个小兵，但他是神与妖的儿子，不但力大无穷，还善使法术。炎帝死后，他便矢志为主复仇。蚩尤看起来虽然粗鲁，但他却不是一个头脑简单的普通莽夫，他先是投靠到黄帝的手下当兵，经过努力，竟被他策反了风伯雨师这两大神人。得到风伯雨师之助，蚩尤便返回南方，举旗一召，应者如云，上古时代最激烈最惨烈的战斗便拉开了帷幕。
黄帝手下的大将有苍颉、风后、神皇、力牧、常先、大鸿、离娄(千里眼)等，神将则有宁封子、应龙、北极玄灵(魃)、雷父电母、四海龙王等，但这么强大的力量，依然只能与蚩尤战成平手，最初的涿鹿之战更是被蚩尤打得大败，几乎全军覆灭。之后又打了几场仗，黄帝都是败多胜少，这时士兵的士气都十分低落，为了鼓舞众兵将，黄帝竟派人去东海流波山，把自己的老朋友“夔”杀“死”，剥皮做鼓。夔是独脚怪兽，擅长用石子打人，他与黄帝交易的条件就是死后可以升入天庭，他成仙后的名字叫做赤脚大仙。黄帝又在雷泽杀掉人头龙身的雷兽(伏羲之父?)，抽出骨头做成鼓槌，有了这面神鼓后，两军再战前，便先擂九通神鼓，响天震地，军心大振，与蚩尤的大战也开始变的有胜有负起来。再后来黄帝得到西王母的阴符经兵法(一说为《黄帝玄女兵法》)，在战神天皇大帝的关门弟子九天玄女的协助下，设下太一遁甲阵才打败蚩尤，斩之于盐湖湖畔。
黄帝之后的天帝叫做帝俊(帝喾)。帝俊这个人比较贤明，深知天下初定和为贵的道理，一有时间就发展生产，在他的统治下，混乱的人间终于平静下来，人民渐渐吃的饱穿的暖，总算过上太平的日子。帝俊在闲暇的时候，最喜欢的就是游览名山大川，在十余年间，他先后认识了他后来的四位人间妻子姜原、简狄、庆都与常仪。携美同游当然是人生快事，但俗话说上得山多终于遇虎，在一次游云梦大泽的时候，当地土霸王房王竟然率众把他与随从们围困起来，无知的蛮族人竟想杀帝俊而代之，成为掌控天下的大帝。玉皇大帝大怒，马上派神龙盘瓠下界，附身去到帝俊的爱犬身上。再说帝俊被困后，贴出了重赏的榜文，提到如果谁能杀了房王，不但能获得大量的财物，还能娶到自己美丽的女儿。想不到当晚房王就被盘瓠咬死，并把头衔来帝俊的跟前，于是帝俊的女儿就嫁给了父亲的爱犬。盘瓠是神仙下凡，见帝女肯为一只狗而遵守誓言，心中十分感动，也爱上了这个心地善良，有情有义的姑娘，便口吐人言，讲出自己原是神仙的真相，并告诉帝女只要把自己放在一个金钟里七天七夜后，就可以恢复回人形。可惜后来帝女因为好奇而提前打开了金钟，令到盘瓠功亏一篑，脑袋还保留了狗头的形状。盘瓠与帝女生有六男六女，成为后来很多个民族的祖先。
玉皇大帝觉得帝俊很会治理天下，于是化身九天真王，传了他一本修道的仙书让他得道成仙，代替自己来担当天帝的工作。那时候没有西游记时代那么多文臣武将，什么事都要亲力亲为，说起来好象权力最大，其实乾坤百废待兴，要做的事实在太多了，看到帝俊这么能干，他马上把这个重担给转移了。
帝俊当天帝的日子并不长，因为万年一轮回的天地浩劫已近在眼前。离开了人间的妻子(姜嫄、简狄、庆都、常仪)，帝俊娶了女神羲和与常羲两姐妹做为自己新的皇妃，不久后羲和生下了十个太阳，而常羲则生下了十二个月亮。
太阳与月亮们都住在东海扶桑，他们出世后，创世神烛阴就不必再每天用自己的眼睛为天地带来光明了。每天早晨羲和带着一个太阳从东方的“旸谷”出发，走六个时辰后到落入西方的“禺谷”，周而复始，其中冬天的时候，因为天气寒冷，他们会很快就走完全全程，而夏天的时候，则会慢慢欣常大地上的湖光山色，但由于太阳每十天才轮到一次，而月亮更是十二天才被轮到出勤，祸根便种下了。
话说这一天，在灵宵宝殿上，玉皇大帝为了妹妹私下凡间与凡人定情之事大发雷霆，为了防止人类力量的增强，筑固自己天帝的统治，在颛顼时代，便已定下神人不可交配的天宫禁令，连天梯也全拆了，想不到自己的妹妹竟带头违抗自己的意志，产下逆子杨戬。为了自己的权威，玉皇大帝把心一横，竟把自己的亲生妹妹压在桃山之下。(也许是不把从人君升为天帝的帝俊放在眼里，在那一段时期里，仙女思凡的事件发生得很频繁，玉皇大帝家的就有七仙女与董永，六仙女与砍柴郎，九仙女与汤郎中等“家丑”;另外还有著名的牛郎与织女事件，桃花仙子、杏花仙子姐妹的悲惨遭遇、莲花仙子与藕郎的一世情缘等等)