建武二十五年（49年），马援率部到达临乡，蛮兵来攻，马援迎击，大败蛮兵，斩俘两千余人。
但是就在马援在岭南浴血奋战之时，后方却起火了，耿舒和梁松两个小人在朝堂之上告马援的状，诬陷马援，加上当时马援在做人方面有点失败，很多权贵都对马援不满，背后说马援的坏话，推波助澜。马援死后，有人上书说马援曾搜刮了一车珍珠文犀运回。马武、侯昱等人也上表章，说马援确曾运回过一车珍稀之物。刘秀更加愤怒。
马援的家人不知皇帝为何如此震怒，不知马援究竟身犯何罪，惶惧不安。马援的尸体运回，不敢埋和原来的坟地，只买了城西几亩地，草草埋葬在那里。马援的宾朋故旧，也不敢到马家去吊唁，景况十分凄凉。葬完马援后，马援的侄儿马严和马援的妻子儿女们到朝廷请罪。刘秀拿出梁松的奏章给他们看，马援夫人知道事情原委后，先后六次向皇帝上书，申诉冤情，言辞凄切。刘秀这才命令安葬马援。前任云阳令朱勃也上书为马援鸣不平。
揭马超的祖先原来是东汉开国功臣
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永平三年（60年），马援的女儿被立为皇后。汉明帝在云台图画建武年间的名臣列将，为了避椒房之嫌，单单没画马援。东平王刘苍观看图像时，问明帝道：“为什么不画伏波将军的像呢？”明帝笑而未答。
永平十七年（74年），马援夫人去世，朝廷才为马援聚土为坟，植树为标记，建筑祠堂。
建初二年（78年），汉章帝派五官中郎将持节追加策封，追谥马援为忠成侯。
公元782年（唐建中三年），礼仪使颜真卿向唐德宗建议，追封古代名将六十四人，并为他们设庙享奠，当中就包括“伏波将军新息侯马援”。
公元1083年（北宋元丰六年），宋神宗追封马援为忠显王。
公元1120年（宣和二年），宋徽宗封马援为忠显佑顺王。
公元1123年（宣和五年），宋室依照唐代惯例，为古代名将设庙，七十二位名将中亦包括马援。
北宋年间成书的《十七史百将传》中，马援亦位列其中。
揭马超的祖先原来是东汉开国功臣
马援与其他开国功臣不同，大半生都在“安边”战事中度过。马援为国尽忠，殒命疆场，实现了马革裹尸、不死床箦的志愿。他忠勤国事，令人钦佩。马援进身朝廷，没有一个人推举荐拔，全靠自己公忠为国。后来居于高位，也不结势树党，堪称一代良将。
而世人知马援者，甚少，可惜可叹，一代千古忠义勇武良将，就此埋没，如今世人，知马援者几人？
