北元林丹汗是指北元时期蒙古最后一位皇帝，名叫林丹巴图尔，他是成吉思汗的嫡系后裔，也是清太宗爱新觉罗·皇太极生平最大的劲敌。
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公元1604年，十三岁的林丹汗即位。此时，蒙古帝国衰落已久，林丹汗励精图治，打算重现往日荣耀，因而他在位期间，曾推出一系列为政举措，虽没能挽回蒙古帝国没落的国运，却也不失为一位英明强悍的君主。
关于北元林丹汗的生平事迹，最早在1606年明朝大臣的奏章《边事大略》中提到。那时，正是林丹汗即位之初，明朝边境武将称之为“穷饿之虏”，可见明朝军事将领们对这位年少即位的“胡虏天子”抱有轻视之心，并未想到他日后会悍然发兵南侵。
公元1612年，林丹汗实力与威望都有长足进步，于是，他亲率三万大军入侵明朝，虽收效不大，却也一战成名。两年后，他再度率军征讨大明，并通过加强汗权的施政手段得以与草原其他部落联合，致使明朝在萨尔浒之战中败北，由此，北元林丹汗威名远播，引起了同样怀有南侵之心的金汉国皇帝努尔哈赤的高度警惕。
金汉国王努尔哈赤的实力渐强之后，曾有意拉拢林丹汗与其一同征伐大明。林丹汗却一早已然洞悉金人的野心，于是拒绝，并一度停止南征，与明朝一同联合抗金。直到满清入关前，北元林丹汗与清太宗皇太极的多年征战才以林丹汗的失败而告终。
林丹汗在谁统治时期被完全征服
北元林丹汗在谁统治时期被完全征服?有关这个疑问，或许应该从明末清初的历史文献中寻找答案。
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公元1617年，林丹汗与大明王朝征战的硝烟刚刚散去。与此同时，东方的努尔哈赤建立了后金汗国，并在其治理之下，国力迅速攀升，一度对蒙古帝国形成了新的威胁。
努尔哈赤颇有政治手段，他曾试图与林丹汗联合征伐大明，并承诺灭了大明之后与蒙古共同分享胜利果实。高瞻远瞩的林丹汗一早洞悉了金人的野心，自然不为所动。不仅如此，林丹汗经过深思熟虑后，毅然决定停止与明朝交战，转而联明抗金，由此，林丹汗与后金皇帝交恶，为日后的战火埋下了伏笔。
在努尔哈赤执政时期，后金与北元多次交战，双方各有胜负，然而因为北元与明朝的战略同盟关系，金人吞并蒙古草原的野心一直未能实现。
至于林丹汗在谁统治时期被完全征服，这便是后话了。努尔哈赤死后，其子皇太极即为，便是后来的清太宗。
皇太极登基后，林丹汗便成为其最大的劲敌。从公元1631年4月至1632年3月，皇太极两次出兵远征察哈尔林丹汗，更传令归顺后金的蒙古各部速率部来会。
当年五月，皇太极集结十万大军，兵分三路穷追林丹汗残部，五月下旬，清军进驻归化城，得知林丹汗已渡黄河而去，于是停止追击。
公元1634年夏秋，复国无望的林丹汗病逝于青海大草滩。由此，问林丹汗在谁统治期间被完全征服，答案当然应该是清太宗皇太极。
皇太极击败林丹汗
满清历史典籍上，记载有关清太宗皇太极击败林丹汗的辉煌战绩。
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公元1632年3月，皇太极亲自领兵第三次远征察哈尔林丹汗，并传令之前归顺后金的蒙古各部率部前来参战，共同征伐北元。一时间，十数万大军浩浩荡荡开赴蒙古草原，一场恶战即将打响。
四月间，蒙古科尔沁、札鲁特、阿苏特等部的部长及主帅领大队人马会集于西拉木伦河岸，十万雄兵整装待发。数日后，皇太极率领后金大军越过兴安岭，驻守都埒河，开始商议排兵布阵大计。
据清宫档案记载，皇太极击败林丹汗一战，并非一帆风顺，其间，也遇到过一些阻力。比如大军驻扎都埒河畔当夜，镶黄旗有两名蒙古族部将偷马出逃，将后金大军压境的消息报告给林丹汗，使林丹汗对此一战有所准备，因而皇太极的偷袭计划并未能得逞。
林丹汗得悉后，立刻召集部将准备抵御。起初，他欲率军撤至漠北喀尔喀，伺机展开反击，然而喀尔喀的三位大汗素日与他不和，此刻并不打算伸出援手。无奈之下，林丹汗率领十万部将，向西奔逃至库赫德尔苏，又渡黄河前往达鄂尔多斯。失去战斗先机的皇太极遂分兵三路，追赶林丹汗部。历经四十一天的追捕，终一无所获。
时至五月下旬，皇太极大军进驻呼和浩特，此时他才得知林丹汗早已南渡黄河而去，哪里还追得上。不得已，皇太极下令停止追击，大军折返。
次一番虽未正面交战，然而皇太极在途中收拢了林丹汗所遗部众数万人之多，北元王朝大势已去，皇太极击败林丹汗已成不争的事实。