阿巴亥被当做政治交易的筹码送给了努尔哈赤，怀着惶恐不安，她周旋在大汗的后宫中，以美貌和机智保住了自己的性命，并登上大妃之位。然而，荣华富贵是短暂的，处于权力争夺旋涡中的她，不时遭到诬陷攻击，随着努尔哈赤的离世，她的生命也悲惨地走到了尽头。
年轻的宠妃
清太祖努尔哈赤虽然创立了后金政权，却并未建立后妃制度。当时正妻称“大福晋”，妾称“小福晋”，后世书籍中称正妻为“大妃”或“皇后”。努尔哈赤前后共有4位大妃，阿巴亥是他的最后一任大妃。
阿巴亥生于明万历十八年(1590)，她是女真乌拉部贝勒满泰的女儿，叔父是布占泰。万历二十一年(1593)，叶赫、乌拉等九部联合进攻建州，结果大败，布占泰被俘。努尔哈赤优待布占泰，甚至还放他回去继承去世的满泰之位。明万历二十九年(1601)，感恩戴德的布占泰将侄女阿巴亥嫁给努尔哈赤做小妾，当时努尔哈赤已经43岁，阿巴亥才12岁。
虽然年龄尚小，阿巴亥却凭着美丽和聪颖赢得了努尔哈赤的宠爱。两年后，努尔哈赤的第三任大妃孟古姐姐(皇太极之母)病逝，14岁的阿巴亥登上了大妃之位。当时努尔哈赤还有多名妻妾，选择年轻且无子的阿巴亥作为自己的正妻，可见他对阿巴亥确实是异常喜爱。
随后，阿巴亥先后为努尔哈赤生下了第十二子阿济格、第十四子多尔衮和第十五子多铎。努尔哈赤爱屋及乌，将阿巴亥生的三个儿子视为珍宝，其中尤其喜爱多尔衮。
老夫总是宠溺少妻，随着阿巴亥在努尔哈赤心目中的地位逐渐提高，她也越来越受到其他人的忌恨。阿巴亥在尽情享受荣华富贵的同时，却没有注意到身后随时可能射过来的暗箭。
宫闱秘案
后金天命五年(1620)三月，努尔哈赤的一个小福晋代音察向他揭发大福晋阿巴亥与大贝勒代善关系暧昧。她说大福晋行为不检点，两次送饭给大贝勒代善，代善受而食之，又有一次给四贝勒皇太极送饭，皇太极受而不食。大福晋还经常派人至大贝勒家，恐怕是在策谋什么事，而且大福晋还几次深夜出宫，行踪诡秘。
代善是努尔哈赤的发妻佟佳氏所生的第二个儿子，自从褚英死后，他便成了努尔哈赤属意的继承人。代善吸取了哥哥的教训，为人处事都十分宽厚小心。努尔哈赤曾经说过，他百年之后，幼子和大福晋都交给代善照顾。
妻子和别的男人有不可告人的来往，这是任何一个男人都无法忍受的。努尔哈赤听到密告后暴跳如雷，他立即派达尔汗虾、额尔德尼、雅逊和蒙喀图四大臣调查此事。大臣们回禀此事属实，他们还说得有鼻子有眼，说每当宴会时，大福晋都会打扮得珠光宝气，与代善眉目传情。
努尔哈赤决定惩处阿巴亥，然而他深知其中的利害关系，也不愿家丑外扬，于是没有将代善定罪，而以阿巴亥将宫中财物私藏于阿济格家中、私赠衣帛给两个将领之妻等罪名剥夺了她大妃的名号。如果不是怜惜幼子无人照顾，努尔哈赤本来还想处死阿巴亥。代善虽然没有受到处罚，但他的名誉也因此大受损害。后又因听信继妻谗言，虐待亲生子硕托等事逐渐失去了努尔哈赤的信任。
那么，这件闹得沸沸扬扬的“私通”事件究竟是真是假?努尔哈赤表示过死后将阿巴亥和幼子托付给代善，阿巴亥也害怕他百年之后，母子失去依靠，因而送些食物以讨好代善是可能的，而且阿巴亥也送了食物给皇太极。再说，阿巴亥遣人至代善家，也并不意味着两人有不正当的关系，半夜出宫也不能证实她去的就是代善家，“眉目传情”一说更是诸贝勒大臣捕风捉影的说法。
再回头来看负责调查的四大臣的身份：额尔德尼是皇太极的亲信，其他三人都隶属于皇太极的正白旗，达尔汗虾还与代善结过怨。这就不禁让人怀疑这件事情与皇太极有关。
这桩蹊跷的桃色事件一箭双雕，既动摇了代善的嗣子之位，又除去了大妃阿巴亥，直接打击到多尔衮兄弟。因此，很多人都认为这件事情是一个阴谋，而且主谋者正是皇太极。阿巴亥就是这场政治斗争的牺牲品。
但史学界也有学者认为，天命五年被告发偷藏财物、与代善有私情而被休离的大妃不是阿巴亥而是富察氏衮代皇后，即努尔哈赤的第二任大妃。《清史稿·后妃传》中记道：“天命五年，妃得罪，死。”其中的“妃”指的就是富察氏。《清皇室四谱》也记载了因偷藏财物被休的大妃是富察氏。
然而理清史料，可以看出天命五年(1620)被休弃的大妃更有可能是阿巴亥。
富察氏生年不详，她是努尔哈赤的堂嫂，先嫁于威准为妻，生下一子昂阿拉。威准死后，于明万历十三年(1585)前后嫁给努尔哈赤，生了二子一女，分别是第五子莽古尔泰、第三女莽古济格格和第十子德格类。富察氏嫁给努尔哈赤时，年龄至少在15岁。代善生于明万历十一年(1583)。天命五年时，富察氏已经50多岁，而代善是38岁，年龄相差如此之大，说两人“眉目传情”很难让人信服。而刚刚31岁的阿巴亥，风韵犹存，才可能与代善“眉来眼去”。
其次，此事发生后，努尔哈赤之所以只休离而不处死大妃的重要原因是孩子年幼、患病无人看护。富察氏最小的儿子德格类生于明万历二十四年(1596)，此时已24岁，用“年幼”来形容是不恰当的。而阿巴亥的三个儿子阿济格15岁、多尔衮9岁、多铎7岁，与努尔哈赤的说法一致。综上所述，因偷藏财物被休弃的大妃应是阿巴亥。
阿巴亥虽然遭到休离，但是努尔哈赤对她的感情仍在，幼子的哭泣也牵挂着他的心。不到一年，努尔哈赤的怒火平息后，重新将阿巴亥接回宫中，恢复了她的大妃之位。阿巴亥的地位失而复得，自此，她更加谨慎小心地服侍努尔哈赤，在千娇百媚的小妻子的刻意逢迎下，老汗王龙心大悦，对她恩宠愈加。然而，随着努尔哈赤的去世，阿巴亥面临人生最大的一个困境。