朱允炆继承了其父亲朱标温厚的性情 ，再加上熟读经书，使得他宽厚正直，有一种读书人的理想主义。朱允炆曾经因上书修改了《明律》里苛责的刑法，从而深得人心。公元1398年，朱元璋驾崩，朱允炆同年六月于应天府继任皇位，是为建文帝。然而上任后的建文帝不久就开始了削藩的动作，一些已经交出兵权的藩王最后还没有个好下场，从而导致燕京的朱棣被迫起兵造反，欲夺自己侄子的天下。
因为年少，加之性情温和，没有多少政治经验的建文帝很多时候没有主见。面对朱棣的造反，建文帝居然下了“勿伤皇叔”的圣命，这很大程度上导致战事的拖延直至惨败。建文四年(公元1402年)，朱棣大军兵临应天府城下，内奸开门迎敌，京城遂即告破。但是建文帝行踪未能寻得，传说城破时宫中大火，从中捞出的几具无法辨认的尸体就是建文帝还有他的长子朱文奎等人。而朱标的后人至此算是一场劫难了，也许还有其他幸免于难，只是无从知晓了。
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