在内政方面，井伊直政先后对井伊谷城、群鹰峰、箕轮城、高崎城、彦根城的建设和开发，取得了一定的成效。尤其是对彦根城的建设，成为了现代日本彦根市的前身。
纵观日本战国时期的群雄，在军事、政治和内政方面，都一样出色的，像井伊直政这样的人是非常罕有的。井伊直政功绩也一直受到德川家康和他的敌人丰臣秀吉的赞扬。
井伊直政评价
在日本的战国历史中，对于井伊直政评价，一般都不外乎其军事、容貌、政治、外交和性格等几个方面。
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在他的容貌和性格方面，《甫庵太閤记》、《塩尻》、《徳川実纪》等史书无不记载说，井伊直政容貌美丽、内心善良。而事实上，井伊直政也确实是当时战国时期的美男子。当他朝觐天皇的时候，朝廷里的宫女都非常喜欢和他搭讪，甚至连丰臣秀吉的母亲，也因为他的容貌而非常信任他。
在军事方面，在小田原城之战中，井伊直政抢了先锋，率先攻入敌阵，为战斗的胜利打下了坚实的基础。战后，丰臣秀吉赞扬他说：攻入之首功也。而在后代的史书中，对井伊直政评价，也颇多溢美之词。如《叶隐》中说他：天下无双，英雄勇士。这样的评价，即使在中国也是非常罕见的。西汉时期的萧何评价韩信说：国士无双。两者巧合般的如出一辙。
在性格方面，当然是接触他最多的上司德川家康的话最有说服力。在德川家康对井伊直政的评价中，几次提到他“沉默寡言”，“胸有谋略”、“稳重”等。这说明井伊直政在别人的眼里，是一个说话很少，但是有大智慧，办事稳重的人。关于这一点，德川家康的敌人丰臣秀吉也非常认可，因此丰臣秀吉曾经三番五次的想要拉拢他。
对井伊直政评价最高的是后人所著的《甲阳军鉴.抜书後集》，书中称他的荣誉和威名，可以倾覆日本。这里虽然带有了一些夸大的成分，但无疑也是对他一生的肯定。
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