据史料记载，康熙帝每次到朱元璋的明孝陵，必定会对朱元璋的陵墓，行三跪九叩的大礼。那么，康熙帝为朱元璋扫墓为何必三跪九叩呢?
去过南京明孝陵的人，都会发现朱元璋的墓前，立着一块大石碑。石碑上，写着4个大字：治隆唐宋。这4个字的意思就是，朱元璋对国家的治理，胜过唐宋。唐宋盛世，闻名历史，而朱元璋建立明朝后，整顿吏治，反贪打虎，将国家治理得井井有条，更胜于唐宋盛世。如此赞誉，出于谁手?写这4个字的，不是别人，是康熙皇帝。
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明孝陵坐落在南京钟山旅游风景区金山南麓独龙阜玩珠峰下，茅山西侧。明孝陵的朱红大门坐北朝南，正对梅花山，门额上书“明孝陵”三字。门外东侧立有一个石刻告示，系清宣统年间两江洋务总局道台、江宁知府以六国文字刻着“治隆唐宋”四个金字，是康熙皇帝南巡谒明孝陵时所题，意为明太祖的功业胜过了唐宗宋祖。 "治隆唐宋"碑的两侧是乾隆皇帝题书的御碑。殿内靠后两边是两块卧碑，东边一块刻康熙帝第一次谒陵纪事，西边一块刻记康熙帝第三次谒陵情形。
明太祖朱元璋即帝位不久，即选择独龙阜为墓地，洪武十四年(1381年)开始营建，工程由中军都督府李新主持，第二年地宫工程即竣工。是年九月马皇后病故，便先行葬入，因马皇后谥号“孝慈”，遂命所葬山陵曰孝陵，与马皇后合寝，同时殉葬宫人十余人，从葬嫔妃四十六人。
为了永远纪念太祖高皇帝，明廷规定，孝陵每岁圣旦、正旦、孟冬、两忌辰酒果行香，清明、中元、冬至、太牢致祭，是谓“五小祭三大祭”，设祠祭署专司其事。
向朱元璋行三跪九叩之礼
早在康熙七年(1668年)四月二十一日，康熙帝南巡时和鸿胪寺正卿周之桂前往南京明孝陵祭明太祖，并亲赐祭文曰：“自古历代帝王继天立极，功德并隆，治统道统，昭垂奕世，朕受眷命绍赞丕基，庶政方亲，前徽是景，明烟大典亟宜肇修，敬遣遄官，代将牲帛爰昭殷遮之忱，聿偁饮崇之礼，伏惟格歆，尚其鉴享。”意为自古以来的帝王，上承天命，登上帝位，权威至极点，但上帝是要他为民建功立业、治理好国家，继承好历朝历代好的典章，这样才能功垂千史。“我康熙受先帝之传位，兢兢业业，为民亲政，今天前来向你洪武帝灵前祭祀，你定的明朝诸多法典中，在继承中有的地方我要作些修改，现带了文武百官为你献上粮食和牲帛，行最崇高的礼义，愿天下永享太平繁盛。”
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康熙二十三年(1684年)十月二十五日，康熙帝到南方巡视，为了争取江南士大夫的支持，在途中，他祭禹陵、祭孔、祭明太祖陵，以拉拢江南的士大夫及明遗民，取得了极好的效果。十一月初一，抵达江宁(今南京)，初二一早，就派遣内阁大学士席尔达一起前往明孝陵祭明太租。康熙极为推崇明太祖朱元璋，为了表示对朱元璋的尊敬，他由甬道旁前行，并行三跪九叩礼至二门外，又于宝城前三奠酒，当时南京的父老百姓数万人在场，一个个感动得流泪。
康熙维护修理明故宫
康熙二十八年(1689年)二月，康熙第二次南巡至南京，以吉祥街织造署为行宫，又一次亲自祭奠明孝陵，并赏赐了守陵人。
康熙三十八年(1699年)正月，淮扬一带水患成灾，康熙帝下诏南巡。二月车驾到达淮安境内后，康熙亲自上河堤视察，吩咐掌管河工的河臣修筑方略，又特命开仓发粟，赈恤受灾州县。四月，康熙一行到达南京，南京军民夹道跪迎。
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康熙进城后的次日便派遣兵部尚书席尔达祭明孝陵，并传谕内阁：“洪武乃为一代创业君，朕前南巡二次，俱特行祭祀，并亲至陵寝礼奠。今巡幸至此，当自往亲祭。”大学士伊桑阿。阿兰泰启奏道，“皇上日前去江宁巡查时，已经亲临祭祀，如今就请不必更烦车驾了。”但康熙仍然传旨道：“洪武乃英雄奋起建功立业之主，不可与他君并，朕当躬往致奠。”随后，康熙便率诸位大臣亲自前往明孝陵祭奠。返程时，康熙路过明故宫，止步徘徊。此时明故宫荒废日久，昔日辉煌的殿宇已茫然无存，树荆遍地，荒芜破败，康熙慨叹良久，作《过金陵论》：“……朕省方南来，驻跸江宁，将登钟山，酹酒于明太祖之陵。道出故宫，荆榛满目，昔凤阕之嵬峨，今则颓垣断壁矣，昔者玉河之湾环，今则荒沟废岸矣。”第二天一早，康熙命令直郡王、诚郡王率大学士伊桑阿。阿兰泰、张立书一同前往明孝陵行礼，安奉孝陵殿内，并传谕道：“朕昨奠洪武陵寝，见墙垣复多倾圯，可交与江苏巡抚宋辇、织造郎中曹寅会同修理，朕御书‘治隆唐宋’四个大字，交与织造曹寅制匾悬奉殿上，并行勒石，以垂永久。”随后，康熙又命直郡王、诚郡王和大学士修建重整明孝陵殿内，但修整时遇到连续阴雨，导致贻误工期，至秋凉时工程才结束。
康熙帝的这一举措受到省文武官员及南京城中父老子弟的拥护，施工期间，前去明孝陵观看者犹如潮涌。大大缓解了当时汉人对清政权的不满情绪，进一步巩固了清王朝的统治。
如今明孝陵殿前的御碑殿内陈列的五块石碑，正中的一块就是康熙三十八年康熙帝———爱新觉罗。玄烨所立。
康熙四十二年(1703年)二月，康熙第四次南巡至南京，入住在吉祥街(今大行宫)织造行宫内，派遣大学士马齐祭明孝陵。