9月13日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例10例，均为境外输入病例（上海5例，福建2例，云南2例，广东1例）；无新增死亡病例；新增疑似病例3例，均为境外输入病例（均在上海）。
当日新增治愈出院病例16例，解除医学观察的密切接触者650人，重症病例与前一日持平。
境外输入现有确诊病例145例（其中重症病例1例），现有疑似病例3例。累计确诊病例2645例，累计治愈出院病例2500例，无死亡病例。
截至9月13日24时，据31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例145例（其中重症病例1例），累计治愈出院病例80415例，累计死亡病例4634例，累计报告确诊病例85194例，现有疑似病例3例。累计追踪到密切接触者823002人，尚在医学观察的密切接触者6527人。
31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者39例（均为境外输入）；当日转为确诊病例1例（为境外输入）；当日解除医学观察18例（均为境外输入）；尚在医学观察无症状感染者378例（境外输入377例）。
累计收到港澳台地区通报确诊病例5501例。其中，香港特别行政区4957例（出院4630例，死亡100例），澳门特别行政区46例（出院46例），台湾地区498例（出院475例，死亡7例）。
云南瑞丽全员核酸检测
9月14日晚，云南瑞丽市召开新闻发布会，宣布采取有关紧急措施，有效阻断疫情扩散传播路径。具体措施包括：
1.对瑞丽城区全员开展核酸检测，费用由政府承担，方案确定之后有关消息将及时发布。
2.9月14日22时以后，无特殊情况不得进出瑞丽市城区，时间暂定一周。
3.全市城区人员居家隔离。
4.坚决严厉打击偷渡者，目前，公安机关正在对杨佐某等人依法追究刑事责任，对组织、协助、容留偷渡者的人员依法严惩。
