谢元即谢玄,因宋代避赵匡胤始祖赵玄朗之讳而改。最后,谢玄又穷追猛打,与何谦(即何谦之)、戴逯、田洛等共追之,再战于盱眙君川,复大破之。俱难、彭超北遁,仅以身免。谢玄部下、参军刘牢之部夺得敌大量辎重及运输船只。
三阿大战,东晋五战五捷,前秦兵开始对晋军望而生畏。谢玄的北府兵得到实战锻炼,威震北国,为四年后淝水之战鼓舞了士气、打下了基础。
回逃路上,俱难、彭超相互指责,俱难一气之下杀了彭超部下柳浑。苻坚闻败大怒,令人追究责任。该年七月,彭超自杀,俱难降为庶人。前秦势力遂被控制在淮河以北,东晋与前秦划淮为界。
太元八年(383年),苻坚亲率八十多万大军南征,意图消灭东晋。晋孝武帝令谢玄统领徐、兖、青州及扬州之晋陵等八万人抗击。在朱序帮助下,谢玄取得以少胜多的著名战例——淝水大战。朝廷加授谢玄前将军、假节,谢玄坚辞不受。
三阿大战,是关乎东晋政权生死存亡的一场重要战役,挫伤了打击了前秦兵的锐气,更打出了北府兵的自信,可以说没有之前三阿大战的铺垫,就没有四年后淝水大战的胜利。
384年,谢玄乘胜北伐,收复北方兖、青、司、豫四州。