因为，终康熙61年在位期间，他就从未彻底击败过准噶尔汗国，他击败的只是已经众叛亲离的噶尔丹而已。从康熙初年准噶尔汗国在首领噶尔丹的率领下崛起之后，清朝与准噶尔汗国之间的战争就从未停歇，这场战争一直持续了近70年的时间，横跨了康熙、雍正、乾隆三朝。也就是说，准噶尔汗国在清朝最鼎盛时期，与清政府相持了半个多世纪。
绿色为漠北及卫拉特蒙古所在地
因此，从始至终，康熙都没有彻底击败准噶尔汗国。虽然康熙年间清政府在战略上取得了优势，但是，康熙却从未真正彻底击败准噶尔部。真正被康熙打败的，只不过是准噶尔汗国的首领噶尔丹而已。
而且，当噶尔丹被康熙击败时，噶尔丹不但外无援兵，甚至连后路都被切断，就连老巢都在同部落的对手控制之中，康熙击败噶尔丹时，他已经成为一个没有了后路的孤军。但即便如此，康熙彻底击败噶尔丹，依然堪称竭尽全力，甚至不惜三次亲征。
清军入关占领天下后，满清八旗成为中国最后一个大一统王朝——清王朝的统治者，不过，与之前多数大一统的王朝不同，渔猎民族出身、骑兵起家的清王朝，有着比一般中原王朝更强的边疆控制力——他们将东北及蒙古草原也纳入了统治范围。
康熙皇帝
也就是说，将草原纳入统治范围之后的清王朝，补齐了多数中原王朝的短板，在骑兵及战马方面，不再弱于游牧民族。也因此，整个清朝200多年的时间内，漠北喀尔喀蒙古从未对清王朝的统治产生过实质性的影响。
然而，就在这种情况下，犹如按下葫芦起了瓢，蒙古高原终于安静了，西域又闹腾了起来：崛起于如今新疆及中亚地区的卫拉特蒙古四部，在准噶尔部首领噶尔丹的率领下，建立了强盛一时的准噶尔汗国，并直接威胁到了清王朝对于西北及蒙古地区的统治。
而且，与其他“其兴也勃焉，其亡也忽焉”的游牧民族政权不同，准噶尔汗国与清王朝对峙了近70年的时间，再加上沙俄的不断暗中捣鬼，有了大量火器支持的准噶尔汗国与清王朝的多次较量均不落下风，噶尔丹领导下的准噶尔汗国成为清王朝鼎盛时期最大的对手。
准噶尔汗国
为什么准噶尔汗国能够坚持如此长的时间呢？这其实与准噶尔汗国所在的地理位置有直接关系。17世纪，卫拉特蒙古4部开始在西域地区崛起。而此时，崛起于东欧的沙皇俄国，也将势力范围扩展至大半个西伯利亚地区。
也就是说，此时崛起的准噶尔汗国，接连接壤了清王朝和沙皇俄国两大帝国。而带领准噶尔汗国崛起，并成为第一任领袖的噶尔丹，也充分地认识到了准噶尔汗国的两大强邻的巨大影响。
对于野心勃勃的噶尔丹而言，他最大的梦想是恢复一代天骄成吉思汗时期蒙古的荣光，他自己则成为带领蒙古再次走向巅峰的霸主。因此，噶尔丹直接将矛头对准了宗主国——清王朝，在这种局面之下，准噶尔汗国实行了讨好联合俄国的战略方针。
沙俄、清朝、准噶尔汗国局势
而已经初步完成工业化、军队装备了大量火枪火炮的沙皇俄国，成为准噶尔汗国最大的外援。因此，与传统的游牧民族骑兵不同，虽然准噶尔汗国内并没有什么工业可言，但是，噶尔丹的军队中却装备了大量的火枪甚至火炮，而这些火枪和火炮，也成为清朝剿灭准格尔汗国军队过程中最大的障碍。这些先进的火器，正是准噶尔汗国能够坚持近70年时间的最大倚仗之一。
所以，被吹捧为千古一帝的康熙与噶尔丹之间的战争，就从未容易过。噶尔丹建立准噶尔汗国之后，为实现野心，就与清王朝直接发生了军事冲突，而且，多数时候，噶尔丹甚至占据了主动权。为了平息西部边疆之乱，康熙皇帝甚至三次亲征漠北。
康熙皇帝三次亲率大军征讨噶尔丹，虽然都取得了胜利，但是，战争的过程显然不是轻而易举。清军与噶尔丹军队之间的战争也从未一帆风顺，在与噶尔丹之间的战争中，清军更多次遭遇失败。
沙俄对西伯利亚的侵略
而且，康熙皇帝考虑的，绝不仅仅只有噶尔丹的统帅能力及其麾下骑兵的强大战斗力，因为，作为一个帝国的统治者，康熙皇帝还必须考虑来自北方、尤其是远东地区沙皇俄国的威胁。
贪婪成性的沙皇俄国，之所以给予了噶尔丹诸多支持，除了对于土地的贪婪之外，沙皇俄国其实一直将噶尔丹当枪使，挑唆噶尔丹与清王朝之间的战争，妄图在其两败俱伤之后渔翁得利，实现其疯狂扩张的野心。
作为一个优秀的统治者，康熙皇帝自然也看到了沙俄的险恶用心，清军在取得两次雅克萨之战的胜利后，却在《尼布楚条约》上对沙皇俄国退步，让出大面积领土，其原因，除了康熙及清廷的短视之外，忌惮沙俄，并希望迅速结束双线作战的局面，也是重要原因。
尼布楚条约
因为雅克萨之战爆发时，对于清朝威胁最大的并不是沙俄军队，而是位于西北地区的数十万准噶尔大军。清军如果同时在东北及西北地区两线作战，限于恶劣的交通条件及有限的国力，清军很可能遭遇惨败，乃至于引发更为恶劣的后果。
因此，从始至终，康熙与噶尔丹之间的战争就从未容易过，康熙甚至不得不对沙俄妥协，从而集中全力消灭噶尔丹。