很简单，因为始皇帝主张实行
“郡县制”
，加强中央集权统治，削弱地方对于中央的威胁。
始皇帝在位时，秦帝国内部对于到底是实施分封制，还是郡县制，曾有过二次激烈的讨论。
第一次是在秦始皇26年（前221年）。这一年丞相王绾上奏始皇帝：
“诸侯初破，燕、齐、荆地远，不为置王，毋以填之。请立诸子，唯上幸许”
，王绾认为此时秦帝国刚刚一统天下，国家统治尚不稳固，而原楚国、燕国、齐国等地的疆土又远离秦国的统治中心，一旦发生动乱，秦国恐鞭长莫及。所以，王绾建立实行西周的分封制，给予诸皇子、有功之臣封土，让其替秦国镇压四方。
与此同时，廷尉李斯却提出来不同的意见，他认为分封制并不好，原因是西周分封诸侯后，整个天下仅过百余年，就发生了相互攻击如仇雠，天子也无法禁止的互相攻伐的事件，最终是让周天子的威信淡然无存。所以李斯就向始皇帝建议：
“今陛下统一天下，应该废除封建制，实行郡县制”
。
而此时，始皇帝也认为：
“天下共苦战斗不休，以有侯王。赖宗庙，天下初定，又复立国，是树兵也”
，此前天下之所以动荡，战乱不休，其根本原因就是因为诸侯并立，中央势弱。如若此时再又分封，岂不是让这类事件再次有了发生的可能吗？由此，始皇帝采纳了李斯的建议，分天下为三十六郡。
第二次是在秦始皇34年（前229年）。这一年，博士齐人淳于越劝谏始皇帝：
“臣闻之，殷周之王千馀岁，封子弟功臣自为支辅。今陛下有海内，而子弟为匹夫，卒有田常、六卿之患，臣无辅弼，何以相救哉？”
，大意就是“我听说殷商和周朝统治达千年，而他们之所以能那么长久，主要原因就是商周的统治者分封子弟及功臣作为膀臂辅翼，来帮助自己镇压四方。而今陛下您虽统一天下，但子弟却还是白丁，若之后出现前齐田常、前晋六卿夺权篡位这样的事情，而朝中又没有忠臣良将的情况下，试问谁来救？”，淳于越希望始皇帝封子弟功臣，夹辅王室，以防止重蹈田氏代齐的历史覆辙。
当然，淳于越这个建议遭到了李斯的强烈反对，李斯反驳道：
“古者天下散乱，莫能相一，是以诸侯并作”
，他认为淳于越的建议十分荒缪，先秦时期，之所以战乱不断，就是因为天下没有一统，诸侯并立。而始皇帝亦也认为如此，所以并未接受淳于越的建议，他依然是坚持实行“郡县制”，而放弃“分封制”。
简单地说，
始皇帝之所以不分封自己的子孙为诸侯王，其主要原因就是因为他害怕自己百年后，自己的这些子孙会为了自己的私利，会为了独占这天下，而行互相攻伐之事，从而致使民不聊生，天下分崩离析，更甚者让秦朝天下被他姓所夺
。所以始皇帝坚持不实行分封制，而是使用“郡县制”，有中央直辖地方，从而加强秦朝对于天下的掌控，籍而削弱地方对于中央的威胁。
当然，始皇帝坚持使用“郡县制”，还有一点原因，那就是当时秦朝的上层统治阶级，多数都是法家。自前356年法家商鞅在秦国实现变法，法家统治思想就俨然成为了秦国的主流思想，法家是主张灭国的，就是这世上只有一位统治者，不能有其他有着相同权威的统治者的存在。而在始皇帝建立秦朝时，法家出身的官员是占据着朝堂多数位置，秦帝国的政治架构与运作，全靠此阶层来实现，明法成为秦朝评价官吏优劣的圭臬，这时甚至连皇族都要学习法家，如
“高受诏教习胡亥，使学以法事数年矣，为尝过失”
。
因此，正因法家掌控了秦国的政治，其所提倡的“灭国”思想自然就被始皇帝所接受。由此，“郡县制”取代“分封建”，这也就成为理所当然的事情。