这可真是冤枉了唐僖宗，如果能用一个官职就解决的事情，唐僖宗会狼狈不堪的随着田令孜跑到了四川？关键是宦官们和宰相们非要觉得黄巢是小贼，就是不肯给他一个合适的官职，而且双方互不信任，所以黄巢只能一路开打，一直等到赶跑了唐僖宗，然后自己做了皇帝。
其实最开始，王仙芝和黄巢造反归造反，但并不彻底，也就是说是非常容易被收买的，胃口也没有那么大，但朝廷官员非要认为他们就是小贼，很容易就能把他们镇压下去。当时宋威是唐军的统帅，他对待起义军的态度是模棱两可的，换句话说就是宋威更关心自己在地方上的势力，为此他不惜撒谎甚至消极平叛。这让王仙芝和黄巢领导的起义军迅猛发展，破坏性极大。
876年，王仙芝在攻打汝州城的时候，俘虏了当时宰相王铎的弟弟王镣，等到了这一年年底起义军攻打蕲州的时候，王仙芝就让王镣给蕲州刺史裴渥写信，希望裴渥能够向朝廷传达王仙芝想做官的想法，裴渥考虑到自己根本打不过王仙芝，就真的给自己的老师王铎写了一封信，信件到了长安，唐僖宗召开高层会议，让宰相们来商量这件事怎么办。实际上宰相们对于起义军的认识是很不全面的，他们认为王仙芝是整个起义军的领袖，只要安抚了他就安抚了起义军，而且当时他们还认为王仙芝不过是一个小贼，依旧没有认识到起义军的可怕。所以宰相们商量到最后，在王铎的坚持下，他们决定让王仙芝做左神策军押衙，王仙芝动了心。
但是另朝廷没有想到的是，他们忘记了黄巢和其他的起义军首领。朝廷错误的估计起义军只有一位首领，却没有想到起义军中有着众多的小头目，手底下各有忠于自己的小喽啰，他们聚在一起是因为共同的利益。所以黄巢怒了，他直接殴打了王仙芝，骂王仙芝只考虑自己，不顾五千个弟兄死活，群情激昂，王仙芝被迫放弃了这个官职，继续造反。只是从此以后，王仙芝和黄巢开始分离，一般情况下各干各的。
第二年，也就是877年开始，朝廷针对起义军制定了比较宽容的投诚条件，而且王仙芝不断表达自己想要投降的意思，只是宋威一直隐瞒不报。这一年的年底，因为当时朝廷已经把起义军中的许多小头目都归于大赦的行列，于是王仙芝让尚君长等头目去长安与朝廷谈投降事宜，但是宋威却在半路上把他们全部劫持并杀害，告诉朝廷这些人都是他在作战中俘虏的。这激起了王仙芝更激烈的反抗，但是很快王仙芝就被杀死。这支义军分崩离析，尚君长的弟弟尚让带着部分人投向了黄巢，这之后，黄巢成为唯一的领袖。
但是，黄巢从这之后在一段时间内组织的进攻都以失败告终，于是他决定投降，他通过天平节度使向朝廷谈投降事宜，朝廷很快同意让黄巢做禁军的右卫将军，但是令人意想不到的是，黄巢又突然决定不去投降了（很可能是想到了尚君长等人的被杀），继续他的造反事业。只是中原越来越容不下他，于是他决定南下，一直到远离朝廷的长江三角洲去开辟新战场。
879年，在黄巢兵临广州的时候，他再次想到了投降，他让越州观察使崔璆联系岭南东道节度使李迢，上书让他做天平节度使，但是唐懿宗的宰相们和宦官们拒绝了黄巢，连同要不要给个正员将军的官职也没有达成一致意见。接着黄巢又要求做广州节度使，又被拒绝了。最后朝廷决定让黄巢做率府率，这次换黄巢拒绝了，并在一天之内攻下了广州。黄巢本来想以广州为据点，但是很多人感染疫病，这让起义军很恐慌。不久，黄巢决定北上，朝廷派高骈抵抗起义军。
880年，黄巢在北归受阻的情况下又向高骈提出投降，条件是让他做节度使，只是这一次黄巢并不是真想投降，他已经对朝廷失去了信任，高骈自然非常欢迎黄巢投降，很快就给朝廷上表要求让增援的诸道兵返回。等他们都撤的差不多了，黄巢变卦了，趁唐军不注意，继续顽强抵抗，这一年的年底，唐僖宗逃亡四川，黄巢占领了长安。