无孔亚纲中的杯龙是现在所有爬行动物的祖先。
下孔亚纲也被称为似哺乳爬行动物，包含羊膜动物中所有与哺乳类关系较近的物种，分为盘龙目和兽孔目，是第一群有不同牙齿的四足动物，这些不同牙齿包括犬齿、臼齿、以及门齿。
盘龙目：早期的似哺乳爬行动物，是出现于石炭纪晚期的第一批爬行动物之一。
盘龙目的始祖单弓兽是最早的下孔亚纲类动物。盘龙目是第一批在地球陆地上占据优势地位的羊膜动物，它们在石炭纪晚期占据主要地位。盘龙目体积庞大、四肢成躺卧状态、冷血、大脑很小。它们是那个时代陆地上最大的动物，可达3米长。
石炭纪末期发生了小冰河时期。南方的冈瓦纳古陆为当时的南极，冰期发生时，冰盖大面积延伸。冰期使得北方劳亚古陆原本温暖湿润的气候变得干冷起来。喜欢温暖湿润气候的蕨类植物数量大大减少，而裸子植物（种子繁殖）发展较快，这为爬行动物的发展提供了食物来源。所以爬行动物和裸子植物能够在劳亚古陆迅速发展，因为它们都是真正摆脱了水的影响的新一代动植物。
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