由于吴三桂的对明朝势力不择手段的绞杀，取得了清朝皇帝的信任，放手放权给他。在云南，吴三桂自己当家做主，辖下的各级官吏，他可以“选用自擅”；用人征兵，清朝吏、兵二部不可干涉，清廷所给云、贵二省督抚的敕书，都要写入“听王节制”四字，吴三桂纵容部下将吏为非作歹，鱼肉百姓，更没有人敢告状。吴三桂势力膨胀之后，加上康熙削藩的压力，让吴三桂终于爆发造反，一度还将清军打得狼狈不堪，若不是吴三桂早死，康熙平三藩更加艰难。
毫无节制的放权如同放火，大到难以控制，甚至引火烧身。所以整顿吏治，最好将权力放进制度的笼子里。史学家吴晗指出朱元璋执政一朝，“是历史上封建政权对贪污进行斗争最激烈的时期，杀戮贪官污吏最多的时期。”
朱元璋在云南的布局确实老辣，通过镇守太监、沐氏家族、抚按三司这方势力互相制衡，让地方权力对皇权的威胁始终在明朝廷的掌控之中，客观上也保护了沐氏家族不至于像吴三桂一样铤而走险，遭到灭族之祸。
