拉文纳城中著名的圣维塔教堂内，描绘查士丁尼大帝的马赛克作品
查士丁尼一世的6世纪上半叶征服中，成功灭亡东哥特王国，将罗马和拉文纳重新纳入罗马帝国版图，并很快在那里兴建了宏伟的基督教堂。然而，东帝国在重新占据意大利后，发现罗马先人的发祥地已经破败不堪，远不及东方那般繁荣富庶。除了连年的战争之外，北非粮食供给的减少也是罗马城和意大利凋敝的原因之一。东帝国对意大利和罗马城的经营热情也随之降低。
6世纪末，仅仅收复意大利地区半个世纪后，疏于防范且兵力不足的意大利地区就被另一支日耳曼人——伦巴底人渗透。584年起，拉文纳成为东帝国在意大利的统治单位——拉文纳总督区的首府，担当着抵挡蛮族和统筹意大利领土的任务。
590年的意大利形势，东罗马统治区（橙）被伦巴底（绿）入侵者分割开来
经过一个半世纪的渗透后，伦巴底人已经在意大利占据优势，东罗马帝国则因为内外因素逐渐丧失意大利的故土。751年，东罗马帝国最后一个拉文纳总督被伦巴底人废黜。罗马教宗发现东帝国已经在当地无力回天，转向法兰克国王丕平求助，不久在法兰克人的帮助下形成了世俗合一的教皇国。
与拉文纳相距不远的 威尼斯也曾是东罗马的土地（详细阅读：《拜占庭-威尼斯恩怨情仇》），586年当伦巴底国王阿尔博因入侵到意大利东北后，当地的东罗马公民逃到了海边泻湖一个名叫Torcello（意思是小塔）的小岛上避难，并逐渐在这个低洼的地区生活。
威尼斯圣马可教堂
7世纪末，泻湖的东罗马遗民在附近地区尽归伦巴底人时，于当地成立了一个城邦政权，选出了自己的首任总督——保罗·卢西奥·阿纳费斯托。利用独特的地理位置，威尼斯逐渐成为了亚得里亚海乃至地中海的海上贸易枢纽，并为保证海上贸易诞生了强大的海军。
在11世纪时，威尼斯海军的实力就超越了东罗马的拜占庭海军。并在后来1204年十字军洗劫君士坦丁堡的过程中，起到了关键作用。
位于巴尔干半岛西海岸的伊庇鲁斯地区的 底拉西乌姆（今都拉斯），与意大利半岛东端的布林迪西构成了亚得里亚海的门户。在东西罗马分裂后，这里就成为了守护帝国巴尔干领土的西方门户。
虽然她一度被强大的保加利亚帝国控制，但巴西尔二世时期恢复了拜占庭的支配权，保加利亚第一帝国的末代沙皇在攻打底拉西乌姆的过程中战死。
现代都拉斯的拜占庭城堡遗存
底拉西乌姆的地位提升来自于11-13世纪的拜占庭-诺曼战争（详细阅读：《诺曼-拜占庭恩怨史》）。东帝国再此与强大的诺曼人西西里王国展开争夺，诺曼人一度占领这里后杀向希腊地区最大城市萨洛尼卡。十字军占领君堡后，这里被给予威尼斯人，不过很快被拜占庭残余势力之一的伊庇鲁斯专制国收复。
但随着伊庇鲁斯专制国的的不断衰败，底拉西乌姆逐渐成为拜占庭希腊人、阿尔巴尼亚人、匈牙利人和塞尔维亚人混居的地方。阿尔巴尼亚人在1272年建立独立王国后，与威尼斯人联盟不断扩大在巴尔干的势力，最终底拉西乌姆逐渐演变为阿尔巴尼亚语今日的“都拉斯”。
现代锡尔米乌姆的宫殿遗址
此外，由于巴尔干北部腹地的大片领土，在7-10世纪和13-16世纪两次长期脱离东罗马的控制。罗马帝国的几座历史名城，如 锡尔米乌姆（今塞尔维亚斯雷姆斯卡米特罗维察）、 奈索斯（今塞尔维亚尼什）和 塞尔迪卡（今保加利亚索菲亚）等城市没有在本文中详细描述，但他们都是东罗马帝国巴尔干地区的最重要城市，只不过在中世纪的多数时间里，这里已经成为斯拉夫人或者保加利亚人的乐园。
