不过朱温对崔胤早有怀疑，虽然同意崔胤重建禁卫军，但私下派遣手下士兵去长安接受招募，崔胤对此一无所知，估计还很高兴这批兵源的高素质，每天都在积极补充装备训练士卒。
天祐元年（904年）正月，朱温以崔胤“专权乱国，离间君臣”的罪名把崔胤拿下，这八字罪名一点儿都没错。数日后，朱温派兵围住崔胤等人府邸，杀掉了崔胤及其党羽。
这个崔胤，一直想在几个藩镇之间搞平衡，并想借机掌控天下，结果这种小心机在绝对的实力面前不堪一击。
【迁都洛阳，十三朝古都已成绝唱】
之后就是皇帝了，朱温以李茂贞等人兵进京畿为由，要唐昭宗迁都洛阳。唐朝皇帝自唐高宗李治开始就是长安、洛阳东西都两头办公，迁都却是第一次，也是唯一一次。
长安城虽然屡经战乱，但仍然人口众多，整体搬迁是个耗时良久的大工程。但在朱温大军逼迫下，百官士民只得一路东行，“号哭满路”，痛骂崔胤勾结朱温才让长安百姓遭此劫难。不过骂崔胤实在是太表面化了，真正该被骂的应该是唐王朝这些高高在上的皇帝们。
朱温在唐昭宗离开长安后，命人拆毁长安皇宫及城中房屋，把木材顺渭河而下，“长安自此遂丘墟矣”，这座十三朝古都从此成为绝唱。
离开长安一路向东到了华州，百姓夹道呼喊万岁，唐昭宗这时似乎是真的明白了，哭着说“勿呼万岁，朕不复为汝主矣！”一路走，一路哭。
也许，这种态度引起了朱温的杀心，唐昭宗要是有刘禅乐不思蜀的表现可能会多活几年。
（长安）
这里还有个小插曲，唐昭宗设宴款待朱温和韩建等人，何皇后亲自手捧玉卮给朱温敬酒，同时一位贵妇晋国夫人在唐昭宗身边耳语。韩建当时就在桌子底下踩了踩朱温的脚，朱温明白过来，没喝这杯酒，这也是韩建这个降将得到朱温信任的开始。
实际上朱温完全可以放心大胆的喝下这杯酒，以唐昭宗的性格来看，他根本没有勇气在酒中下毒谋害朱温，更没有勇气承受双方撕破脸的后果。
这种事情后来还有一次，也是唐昭宗请朱温私下吃饭，但朱温担心有危险而拒绝了。实际上这只是唐昭宗试探朱温态度的一种手段，朱温大可不必如此担心。
不过换个角度来说，二人相看两相厌，还要在表面上做出一副君臣和谐的肉麻姿态，这饭不吃也罢，唐昭宗是个闲人，朱温可是个大忙人。
【帝王的末日】
当时洛阳宫殿尚未修缮完成，唐昭宗在陕州（现河南三门峡）停留了两个月，也不知看到黄河之水滔滔东去有何感想。但既已如此，唐昭宗只能每天和皇后“终日沉饮，或相对涕泣”。
天祐元年（904年）闰四月，洛阳宫殿建成，唐昭宗在朱温催促下到了洛阳。途中，朱温觉得唐昭宗身边服侍的二百多“击球供奉、内园小儿”看着碍眼，就在会餐时全部勒死，然后选了二百个年龄体貌类似的亲信代替，“自是上之左右职掌使令皆全忠之人矣”。
朱温一直觉得唐昭宗的存在对自己会是个威胁，尤其那些对头还经常拿唐昭宗说事儿，到当年八月，朱温失去了耐心，派人前往洛阳对唐昭宗下了毒手。
当夜，朱温的头号心腹手下蒋玄晖率百名士兵进入内宫，唐昭宗刚刚还在借酒浇愁，发现情况不妙，就“单衣绕柱走”，都这种情况了，走能走到哪里去？被士兵追上一剑砍倒，享年三十八岁，一起死的还有唐昭宗的几个妃子。
第二天，蒋玄晖说唐昭宗妃子谋杀了皇帝，以何皇后的名义立太子并继皇帝位，也就是后来的唐哀帝，当时只有十三岁。
朱温也知道自己这个事情办得比较粗糙，还装模作样的在唐昭宗灵前痛哭，向新皇帝请罪，并杀了洛阳守将朱友恭等人想堵住天下人之口，后来蒋玄晖也被朱温杀掉。
朱温虽然进入了挟天子令诸侯的新阶段，但本人底蕴太浅，气度不足，缺乏政治手段，手中更没有优秀的谋略人才和能够颠倒黑白的笔杆子，不但没有好好利用手中的皇帝以令不臣，反而让皇帝成了李茂贞、李克用、王建、杨行密等人攻击自己的借口。
（毁于安史之乱的洛阳明堂天堂，唐昭宗一生未曾见过）
对于唐昭宗来说，死亡应该是意料之中的事情，甚至可以说是他一生悲剧命运的终结，再持续下去无非是更大的痛苦。这位志大才疏的皇帝，十七年前从哥哥唐僖宗手中得到皇位的时候，形势虽然险恶但尚有一线生机，但这一线生机被他一系列错误决策亲手葬送，这才有了如此结局。
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