同与不同
中泰证券表示，将创业板与科创板注册制比较后发现，与科创板专注科技前沿不同的是，创业板更关注成长型的创业创新。定位的差异也体现在上市标准方面，创业板的盈利要求略高。尤其是对红筹企业的业绩要求进一步细化和补充。
首发方面：创业板与科创板错位发展，区别在于创业板对股票发行的盈利要求略高。科创板与创业板在发行条件、审核注册程序、发行承销、信息披露等方面是颇为类似的。主要区别在于：对一般企业而言，相较创业板，科创板上市对研发的要求更加细致；对红筹企业而言，创业板的财务要求与科创板相似，并且对盈利做了补充。
再融资方面：创业板与科创板较为相似，区别在于创业板对股票发行的盈利要求更为严苛。创业板与科创板在适用范围、发行上市审核、注册程序、强化信息披露要求、强化监督管理和法律责任等方面是颇为类似的。尤其是两者先后出台规则，针对“小额快速”融资设置简易程序，进一步完善注册制的重大决策部署。主要区别在于股票发行中创业板明确提出最近二年盈利，净利润以扣除非经常性损益前后孰低者为计算依据的要求。
发行与承销方面：在网下报价数量、超额配售、网下初始发行的比例是较为相似的。但是，创业板与科创板在定价方式、回拨比例、战略配售等方面均呈现较多区别。
此外，值得关注的是，创业板改革借鉴了科创板的有益经验，并对试行保荐机构相关子公司跟投制度做了优化。在跟投主体、资金来源、跟投途径、跟投比例、跟投股份锁定期等方面，与科创板总体一致。不同的是，跟投对象方面对未盈利企业、特殊股权结构企业、红筹企业和高发行价企业实施跟投制度，其他企业不实施。主要考虑是，创业板是一个存量市场，已经拥有相对众多的投资者群体和长期形成的估值定价体系，普通企业跟投的必要性较小。未盈利企业、特殊股权结构企业、红筹企业对创业板是一个新生事物，商业模式、经营方式、股权架构等方面的潜在风险与普通企业有较大差异，高价发行企业投资风险往往也较大，有必要通过跟投，督促保荐机构更好履行“看门人”职责，审慎合理定价，控制风险。
交易条件：创业板与科创板在涨跌幅限制、盘后定价交易、两融交易方面较为相似，但在参与门槛上，创业板个人投资者参与条件更低，在单笔交易的数量上来看，整体还是高于科创板的。此外，值得关注的是本次创业板改革系统完善了创业板交易机制，同时适用于增量公司和存量公司，有利于提高创业板整体定价效率。
中泰证券研究发现，从创业板注册制首批上市公司与科创板首批公司对比来看，相似的是，首批科创板与创业板的公司均主要集中在工业、信息技术领域，企业平均融资额与科创板都集中在10亿-15亿元；区别在于创业板的首发市盈率更低、公司平均利润收入能力相对更弱。
行业方面：工业、信息技术首发占比过半。科创板与创业板首发公司普遍集中分布在工业、信息技术两个大类行业，合计占比超过50%。细分来看，创业板首发上市公司最多的公司是技术硬件与设备（3家）/资本货物（3家）；科创板首发上市公司最多的公司是资本货物（9家）。值得关注的是与科创板相比，创业板首发公司的行业分布更加广泛，消费、公用事业、运输、传媒本次均有上市公司崭露头角。
市盈率方面：创业板的首发市盈率小幅低于科创板。创业板18家企业发行市盈率在19.1倍至59.7倍之间，平均值39.3倍，中位数37.9倍；科创板25家企业发行市盈率在18.8倍至170.5倍之间，平均值53.4倍，中位数46.2倍；分行业看，平均口径下，除了医疗保健行业创业板首发PE略高于科创板，信息技术、工业、材料板块的发行市盈率显著低于科创板。
募集资金：创业板首批募集200亿元，企业平均融资额与科创板相似。首批创业板18家公司募资总额达到200亿元，平均融资额11亿元，行业融资差异并不明显。类似的，首批科创板25家公司募资总额达到370亿元，平均融资额15亿元，大类行业平均融资额普遍在10亿-20亿元。
财务情况：首批创业板上市公司平均盈利能力弱于科创板公司。中泰证券以2019年的财报为基础进行测算，创业板首批上市的18家公司平均营收10.7亿元，低于科创板26.5亿元；利润方面，18家公司平均利润1.7亿元，同样低于科创板3.3亿元。即使剔除了科创板业绩最大值中国通号（688009.SH），创业板平均利润低于科创板首批平均利润的现象依然存在。
植信投资研究院表示，科创板与创业板虽然均服务于创新型公司，但其中板块的定位存在差异，逐渐形成互补趋势。科创板主要服务于符合国家战略、突破核心技术、市场认可度高的科技创新企业；创业板主要服务成长型创新创业企业，支持传统产业与新技术、新产业、新业态、新模式深度融合。在创业板注册制开启后，创新型公司上市数量将有所提升，进一步与科创板形成互补状态，使创新型公司发展趋于完善。
在两个板块形成互补状态的同时，当然也存在一定程度的竞争关系。从长远来看，这种异同并存制度将促进双方良性竞争，不断优化体制，实现共同提高，为拟上市企业、投资者带来更好的投融资环境，给资本市场发展带来新的活力。科创板、创业板注册制改革可以看作是这一轮资本市场改革的龙头，预计其他板块也将在适当时机逐步推行注册制，最终实现资本市场全注册制改革目标。
存量冲击
创业板注册制的实施将不可避免地对存量创业板公司造成冲击，中泰证券认为，从短期看，虽然创业板新股上市对存量市场的流动性冲击并不大，但是考虑到目前创业板估值整体偏高，流动性驱动转弱叠加壳贬值预期，市场估值、股价有望迎来加速分化。
流动性方面：注册制后，首日新股上市对存量市场虹吸效应并不大。从目前披露的数据看，18家公司募资总额达200亿元，考虑到战略配售和网下配售10%的账户无法在首日卖出，实际可流通市值低于200亿元。参考科创板首日换手率与涨跌幅，创业板注册制首批当日成交额对市场流动性的冲击有限。
估值方面：创业板目前估值整体偏高，流动性驱动边际转弱后，一方面，存量市场高低切换的风险提升；另一方面，壳价值贬值预期的升温，也会加速估值的分化。目前创业板综指的PE（TTM）62.5倍，处于2010年6月以来历史分位的67.4%；创业板成指PE（TTM）69.5倍，处于历史分位的89.7%。注册制后，“有进有出、优胜劣汰”的良性循环机制，在提升上市公司质量的同时，也会加速存量市场的分化。
