当地时间16日上午9点多，日本政府召开临时内阁会议并汇总了阁僚的辞职信，安倍内阁全体辞职。16日下午，在众参两院的全体会议上将举行首相指名选举，自民党总裁菅义伟将被选为第99任日本首相，并预计于当天成立菅义伟内阁。
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至此，历时7年零8个月的第二次安倍政权正式宣告落幕。
16日，菅义伟将在首相官邸与公明党代表山口那津男举行党首会谈后，设立组阁本部，进行内阁人事变动，新任官房长官将发表内阁成员名单。然后经过在皇居的亲任仪式和阁僚的认证仪式，16日晚，菅义伟内阁将正式成立。菅义伟在就任首相后将召开记者会，就内阁人事安排的目的和今后政权的运营等问题表明自己的想法。
解读
执政后将面临哪些挑战
1.处理好疫情防控与经济振兴的平衡
菅义伟上台后，他将不得不在疫情防控、企业救助、家庭和个人救济、国家财政健全等方面做出艰难选择与平衡。此外，明年东京奥运会能否如期举办取决于疫情防控，关系到经济振兴，其变数也是新政府的一大难题。
2.处理好“继承安倍政权”的利弊
菅义伟虽然高举继承安倍既定政策的大旗，但安倍留给他的政治遗产有正有负，难以一概“继承”。分析人士指出，菅义伟长期担任安倍政府内阁官房长官，深度参与了安倍政权各项重要政策的制定，在经济、安保、对外关系等主要领域的政策框架有望延续。但同时，安倍执政期间的一些丑闻如森友学园、加计学园、“赏樱会”等问题未必能在安倍下台后自动“翻页”，在野党已放风将在菅义伟内阁上台后继续追究上述丑闻和菅义伟在其中扮演的角色。
3.如何巩固权力基础
安倍的自民党总裁任期原定要到明年9月，菅义伟虽然当选为新总裁，但接下的只是安倍的剩余任期。明年9月自民党总裁选举将采用正常选举规则，即基层票数与国会议员票数相当。这意味着，菅义伟届时可能再次面临石破茂等人的强力挑战。作为党内无派阀人士且出身平民，菅义伟能否巩固党内权力，很大程度取决于他今后一年间的执政表现。