宗罗睺失败后，开始向西溃败，李世民立即组织二千多骑兵进行追击。他的堂舅窦轨下马苦谏：“薛仁果城池完好，虽然攻破宗罗睺，但他的军队大部分人都还在，不可轻率前进”但李世民不听，说：“我考虑很久了，破竹之势，不可丧失，舅舅不要说了”。李世民一路追击到折墌城，与薛仁杲相遇。虽然，薛仁杲军队数量众多，但是军心已乱，他部下数名将领当着他的面投降唐军。薛仁杲只好领兵退回城里，想要婴城固守。可惜，唐军的主力很快赶到，将折墌城围了个水泄不通。薛仁杲无计可施，只好开门投降。
灭薛秦之战是唐朝开国最艰难的战斗之一，也是唐朝开国以来第一次翦灭强敌，至此之后唐朝的关中腹地再无后顾之忧，可以顺利的东出函谷与群雄争夺天下。
