守孝期满后，陈于陛三次出山，先任户部左侍郎，后升任南京户部尚书。明制设两京，即北京和南京，均设六部。在入朝拜贺的途中，适逢酷暑六月，因中暑病逝于途中。陈于陛病故后，“简其装俸余八金而已”。人们在整理他的行装时，发现仅剩下八两银子！
陈于陛身为皇师，官至户部尚书，经手钱粮逾亿万，但他两袖清风，一尘不染，而对贫苦百姓极为关怀，史书上说他“公性清洁，喜周人，戚党待举火者数十家”。意思是陈于陛清正廉洁，喜欢周济他人，他的乡亲中有穷的等米下锅的，柴灶没有点火的有数十家，都得到了他的救济。他还“易谷储社仓”，用余钱买成米谷，储在义仓里，准备遇到灾荒，救济穷人。
陈于陛对德才兼备的青年甚为器重，经他推荐提拔的不下数十人。曲周北寺头村张师孟因家庭贫困，请不起老师，上不起学，常来向陈于陛请教。陈于陛乐为人师，耐心教诲，在他的资助下，张师孟于万历丁未年考中进士，官至太仆寺少卿。
陈于陛治家严谨，以诗书传家，对其弟陈于阶执教甚严。后陈于阶于万历二年考中进士，官至怀隆兵备、山西副使，因兄弟二人都中过进士，因此有“一门双进士”之称。
陈于陛“终生不置家产”，薪俸多献于慈善事业，病故后，家中空荡，“无长物”，以致他的儿子无力葬父，“事闻于帝”，万历皇帝知道了这件事，“赐祭谕葬”，由皇帝资助，才进行了安葬。“论讲读功”，念他作过皇帝的老师，赠封太子少保。
来源：微观曲周、曲周档案馆
