崇祯元年（公元1628年）魏忠贤被诛后，侯恪重新被启用，复中允兼翰林院编修。辅助丞相韩爌厘正《三朝要典》，请颁钦定逆案。
崇祯二年恪任专门记录皇帝言行的记注，阉党余孽温体仁揣摩崇祯皇帝的心意，偷偷上书言群臣朋党，得召对。在殿上，“体仁钩挑诟谇，数睨望颜色，伏叩头为侧媚曲谨状，天子大悦，趣立以为相”。侯恪真实地记下了温体仁的丑态，并飏言于朝。温体仁担心恪揭他的隐私，多次委屈恳求侯恪给改一改，恪坚决不改。温体仁恼羞成怒，于是建议崇祯皇帝任命恪为南京国子监祭酒，让侯恪远离朝廷。
崇祯二年（公元1629年）侯恪出任业南京国子监祭酒，同年四月分考礼部试，当时的士子得知侯恪将主南雍，奔走相告，言：“安得采首山之铜，铸侯太史像，令长司文衡。”愿入南京太学投奔侯恪门下者，近万人，明兴以来，未之有也。这足可见侯恪公正贤明的形象深入人心。也说明了侯恪也深得天下士人的仰慕和爱戴。
在侯恪主持南京国子监期间，与司业倪元璐校理二十史，补其阙遗，定监规。又针对科举中的弊病上疏陈七事，即：“严班期”、“重文行”、“劝实学”、“抑奔竞”、“隆监体”、“核廪饩”、“优迁转”。他励精文治，慨然大有为，常劳废寝食。崇祯帝欲拔入内阁。可是正当侯恪满怀治国安邦之志，准备大展宏图之时，不幸积劳成疾，中风后，右手臂麻木，后又带病工作，病情加重，于是告病回归故里。一年多以后，侯恪于崇祯七年七月十二日病卒。年仅四十三岁。
侯恪的从子侯方域在《司成公家传》里说：“天下皆以有公宰相器，痛惜之。”侯恪英年早逝，失去大展宏图为大明王朝效力的机会，而大明帝国的士子们也失去一名良师，大明王朝也失去一位具有治国安邦的宰相之材，真是造化弄人，可叹可惜。
3、侯恪的文学成就和价值
侯恪一生著述颇丰，不仅有史学著作《补元史刑法志》，还有《眠云阁集》、《嘤鸣集》、《静竹斋前后二集》、《片石轩存稿》、《随史漫录》、《归田草》、《遂园诗草》、《雍余草》、《馆阁试草》等诗文集。
他在文学上的突出成就是诗歌。他的诗推崇杜甫，以大雅自命，反对当时明末文坛流行的公安、竟陵诗派，反对“为独抒性灵”而忽视社会实践。侯恪的诗继承了杜诗的现实主义精神，多哀时伤世，真实反映社会现实之作。姚希孟评价其诗歌：“原本杜陵而兼储光义、刘虚、陈子昂之意。”
侯恪在文学理论上承前七子之余绪，是一个复古主义者。他教导诸儿说：“传家以忠孝为至，文章以古先为法。”他的文章诗法秦汉，特别推崇司马迁，不喜字句繁褥。”郑三俊在《侯恪墓志铭》说他：“为文章经纬敏妙，而宏博流丽冠天下。”他的这些特点，对侯方域的散文影响很大。也被后来明清时期商丘文人所效法，成为归德诗派的理论基础。也是后来雪苑社文风的先驱，对于明清时期文学发展有着深刻而广泛的影响。
侯恪是商丘侯氏家族当中非常出类拔萃的人物，在明清几百年的历史岁月中，商丘侯氏家族兴盛不衰，出现了众多才华横溢的有用之材和卓越人士，这应该和商丘侯氏家族的“诗书传家”的传统优良家风和家族文化有着密不可分的关系。重视家风和家训的家族教育也是中华传统儒家文化的重要标志之一，更是深受圣人文化熏陶的商丘明清文化的典型性体现。
侯恪和商丘侯氏家族的传统家族文化值得后来者研究，挖掘，学习发现它对于当今现实的意义。以及对于当今社会的家庭教育和家庭文化的影响和启示。
生活在社会当中，我们每一个人身上都不可避免深受传统文化的熏陶和影响，传统文化都在我们不知不觉中影响我们的一言一行，这就是文化的力量。不但侯恪如此，你我亦如此，文化的价值和影响一直存在我们的社会当中，只不过需要我们用心去体会，去发现。
注：本文参考材料
1，康熙年间编撰的《商丘县志》
2，新华出版社1989年出版《宋州古今学人》
3，侯方域《司成公家传》
4，许云《侯恪与<侯太史遂园诗集>初探》
策划：胡继勇 赵继彬 陈月梅
审核：赵继彬
指导：商丘市委宣传部
