明清交替之际，在西北出现了一个准噶尔汗国，不过当时谁也顾不上这里。然而等到清朝入主中原后，准噶尔汗国也已经成为了一个不容忽视的存在，实力不容小觑。
看过康熙王朝的朋友肯定都知道准噶尔的噶尔丹，他是这个政权的首领。正是在他的带领下，准噶尔汗国实力越发强劲，积极向外扩张，称雄西域外，还大有统一蒙古之势。这让大清比较郁闷，在笼络不成后，康熙帝三次御驾亲征，才把噶尔丹彻底击败。
康熙的心腹大患死了，但是准噶尔并没有被消灭，反而又有很角色，尤其是策妄阿拉布坦与其儿子噶尔丹策零统治时期，是准噶尔汗国的鼎盛阶段，号称拥有三十万大军，数次击败清朝军队。
噶尔丹死后，策妄阿拉布坦做了大汗，其实他本来曾经就有机会的，毕竟他的父亲僧格曾经是准噶尔的首领，不过他父亲死后，作为长子的策妄阿拉布坦并没有继位，反而是他的叔叔噶尔丹做了大汗，并一步步让康熙非常头疼。
策妄阿拉布坦不笨，他也知道被康熙打得狼狈不堪的准噶尔已经没有能力再战了，所以他向康熙表示臣服，双方迎来了暂时的和平局面。
可是稍微有点起色的准噶尔汗国并没有老实，反而将目光放在了西边也就是哈萨克，愣是打得哈萨克分裂了，还臣服于准噶尔。
这还不算，面对强势的俄国，策妄阿拉布坦并没有屈服，反而打得俄国在中亚的扩张一度停滞了。并且策妄阿拉布坦还从俄军里面拉拢了一些炮兵方面的人才，为自己的汗国生产大炮。
不过再次强盛的准噶尔汗国又一次和大清矛盾激化，并且刀兵相向。不过双方也是互有胜负，在雍正继位后，双方议和了，划分了边界，并商定互相贸易。
雍正五年策妄阿拉布坦猝死，他的儿子噶尔丹策零继承汗位。噶尔丹策零统治准噶尔虽然只有十八年的时间，但他确实是一位优秀的首领。
本雍正希望利用噶尔丹策零刚刚继位，内部不稳的机会，永绝后患。为了完成此计划，他特地派出了开国功臣费英东的曾孙吏部尚书傅尔丹靖边大将军，率五万精锐出兵征伐，同时他任命岳钟琪为宁远大将军，从西路出师助战，没想到准备如此充分的清军却遭遇了有史以来的最严重的一次大败。
噶尔丹策零，比历史上大名鼎鼎的“噶尔丹”多了“策零”两个字，人称“小噶尔丹”。不过，这位在开疆拓土方面，可比他的父亲策妄阿喇布坦和叔祖噶尔丹都厉害得多，曾经让雍正、乾隆两代清朝皇帝坐卧不安。
客观地说准噶尔汗国经过噶尔丹等人的经营，已经不再是传统的游牧政权。
和大清的康熙雍正乾隆一样，准噶尔也恰好也是噶尔丹以及策妄阿拉布坦父子俩，虽然双方并没有可比性，但不得不说，准噶尔这三位大汗，对大清是个巨大的威胁。
不过随着噶尔丹策零去世，准噶尔再次陷入了内乱，正所谓堡垒永远是从内部攻破的，之后的接班人陷入了夺权争斗，让乾隆抓住了机会，彻底平定了准噶尔汗国，将整个新疆纳入了大清的版图。