红楼梦里，秦可卿这个人物非常重要，在太虚幻境里她是警幻仙姑的妹子，受命与宝玉柔情缱绻，旨在令宝玉领略仙闺幻境之风光，以便改悟前情，留意于孔孟之间，委身于经济之道，她可以说是宝玉的性启蒙者。
在现实的世界中，她是宁国府的长房媳妇，乃重孙媳中第一个得意之人，深受贾母器重。在临死之前，她又托梦于凤姐，为后世子孙未雨绸缪，常保永全提出了许多建设性的意见，高瞻远瞩，高屋建瓴地展示了其非凡的才能与智慧，连凤姐听了都十分地敬畏。
秦可卿几乎就相当于警幻仙姑的一个代言人，对整个贾府作出指导。那么这么重要的人物，且容貌能力出众，曹雪芹为什么却把她放在金陵十二钗最后一位呢？这跟宁府有很大关系。
红楼梦第五回秦可卿的判词是：情天情海幻情身，情既相逢必主淫。漫言不肖皆荣出，造衅开端实在宁。
还有她的那首《好事终》曲子：画梁春尽落香尘。擅风情，秉月貌，便是败家的根本。箕裘颓堕皆从敬，家事消亡首罪宁。都明确指出贾府的衰败消亡是先从宁国府开始。
第二回冷子兴演说荣国府对宁荣二府做了一个详细的介绍，宁国府是长房，荣国府是二房，在地位上宁府是要高于荣府的，但是这个宁国府很快地就败落凋零了下来。
首先表现为人口的调零，至贾珍再到贾蓉这两代都是单传，贾珍还有一个胞妹惜春。反观荣府这边却人丁兴旺，与贾珍同辈的有贾琏、贾琮，贾宝玉、贾环，之前还有贾珠，再下一辈是贾兰，此外还有元春、迎春，探春姊妹，人口众多。
还有家业上的落败，宁府这边由于贾敬一味好道，就由贾珍来袭了官，其子贾蓉花一千二百两银子买了个龙禁尉的虚职，也是不正干。荣国府这边长子贾赦袭着官，次子贾政颇受皇上赏识，如今现已升了员外郎了。
此外还出了元春，探春，一个皇妃，一个王妃，可谓光耀了门楣。宝玉虽不成器，但是却是衔玉而诞，给这个家族也添了几分神秘的色彩。
从联姻的情况上来看，宁府显然没有荣府那么显赫，荣国府这边，有史老太君，王夫人，王熙凤，还有李纨，都是出自名门望族。而宁国府前面的只字未提，尤氏出身平常，秦可卿还是养生堂抱来的女儿，都无法与荣府这边相提并论，所以后期是荣府要高于宁府，而且宁国府后来是沾着贵妃的光才维持其地位。
这还不算，且宁国府风气越来越坏，道德沦丧，究其原因，是贾珍这个当家人首先自己道德败坏，这珍爷那里肯读书，只一味高乐不了，把宁国府竟翻了过来，也没有人敢来管他。
与儿媳妇不伦，与两个小姨子不干不净，上梁不正下梁歪，贾蓉与两个姨娘胡来，比起其父有过之无不及，这一对父子真是把个宁国府弄的是乌烟瘴气。所以柳湘莲才会说“你们东府里除了那两个石头狮子干净，只怕连猫儿狗儿都不干净。”
他说的也是宁府，没说荣府。所以惜春身为宁国府的人却要与宁国府划清界限“不但不要入画，如今我也大了，连我也不便往你们那边去了。况且近日我每每风闻得有人背地里议论什么多少不堪的闲话，我若再去，连我也编派上了。”
凤姐协理宁国府时，众人也说“论理，我们里面也须得他来整治整治，都忒不像了。”焦大醉骂的主要也是这个宁国府，扒灰的扒灰，指向太明显，而养小叔子指向模糊，不知在说谁。荣国府要好得多，至少有贾政在贾母在，这个家里风气就不会坏到哪儿去，也就是大老爷贾赦娶个小老婆什么的，贾琏在外面拈花惹草，宝玉与丫鬟调笑流荡优伶就被打了个半死，下人们聚赌贾母还要下令彻查，这些比起宁国府来都算不得什么。
宝玉虽有些顽劣，但是天性纯良，心性是好的，与贾珍贾蓉不是一个概念。象焦大醉骂这种事是不可能发生在荣国府的，在对待老仆这个问题上，荣国府显然要比宁国府做的好，贾母历来是怜老惜贫体恤下情，如果焦大在荣国府，贾母一定会善待他。
焦大醉骂等于把这个家族最后的一块遮羞布扯了下来，在秦可卿与贾珍的关系上，责任不全在她，她在这件事上是被迫的，是身不由己的，她最后也是因为这件事而羞愤自尽。
但她在这件事上也脱不了干系，必竟这件事令整个家族蒙羞，道德沦丧，这样一个人物是有污点的，所以曹雪芹才会将她放在最后一位，有一种结案陈词，盖棺论定的意味，也有一种警示的作用。
曹公写人物从不偏袒，而是具实陈述，他热爱这些女性，但并不代表她们没有缺陷，他只是在真实的展现人性，根据曹雪芹的正邪两赋理论，王熙凤与秦可卿都属于这种正邪两赋的典型代表。