而原本位于伏见奉行所的新选组，决心突击御香宫的炮兵阵地。如果新选组攻击得手，那么幕府军的正面压力就会大幅度降低，因为政府军一半的火炮都位于这个方向。新选组的突击本质上是成功的，新选组和幕府军的突击队越过掩体发动进攻，通过侧翼迂回攻击的战法连续突破了政府军四道防线。但因为幕府军的增援部队没有跟上新选组的进攻步伐，导致了政府军又夺回了这些防线。在腹背受敌之下，新选组只能败退下去。
而此时大久保利通也已经在朝议里拿到了讨伐幕府的权利，真真正正的把幕府军定义为了'朝敌国贼'。此时政府军就可以大大方方的拿出御旗，全军高呼："我は官军わが敌は！（我乃官军敌为贼！）。"久攻不克的幕府军此时闻听自己成了朝敌国贼，别说官兵各个士气低落，就连德川庆喜也动摇了起来。于是德川庆喜就在1月29日下令撤军，随后又遭到了两次友军反水背叛，最后一路溃退进了大阪。
整个鸟羽伏见之战，就这么稀里糊涂的爆发，然后幕府军又稀里糊涂的失去了胜利。政府军一路高歌猛进，幕府军虽然有心抵抗，但是德川庆喜已经失去了战心，在政府军逼近大阪城时，就丢下部队自己逃命去了。而改变了日本历史进程的戊辰战争，也随着鸟羽伏见之战的结束而彻底爆发了。
参考文献：《戊辰战争全史》
《日本近代史》
《日本的战争》
