菩提祖师在《西游记》中是一个神秘的存在，他既有着神仙之能，却又不居住在天庭，神通广大却又不喜张扬。他所居住的灵台方寸山更是世间难得的幽静之地，连神仙都不知道他的存在。
孙悟空大闹天宫的时候，玉帝和如来对他的来历都不知晓。而如来佛祖生活在西牛贺洲，按道理说，应该知道菩提老祖的存在，但是他却问孙悟空，你的师傅是谁？这就不免有些奇怪了。
如来佛祖在《西游记》中似乎是无所不能的，当年真假美猴王连菩萨都无法区分，佛祖却能够轻易识别出六耳猕猴。西牛贺洲是他的地盘，按道理，他应该知道菩提的存在，但事实并非如此。
花果山老猴
既然这么多神仙都不知道菩提，那为什么当年花果山老猴却知道呢？先从孙悟空到达灵台方寸山找线索。当时孙悟空看见菩提祖师的洞府上写着：“灵台方寸山，斜月三星洞”，仔细揣摩便知，孙悟空是拜了心头之师。心头之师便是虚幻而不存在的，只是孙悟空内心想让自己变强大的一股着念。有了这股着念自然就会有菩提祖师这个心头之师出现来引导他。
花果山老猴可以看作是菩提祖师的一个化身。毕竟一个虚幻的人物，连玉帝佛祖都不知道，一只普普通通的凡猴又怎么会了解？所以说，不管是菩提祖师也好，还是花果山老猴也罢，他们都是孙悟空内心对法术神通的向往从而诞生的化身。孙悟空本就是顺天意而降生，来历非凡，天生就带有神通，他想学法术并不是一件难事。而花果山老猴和菩提祖师是他在修炼过程中所臆想出来的虚幻的人物。