他晚年定居庐山莲花峰下，以家乡营道之水名“濂溪”命名堂前的小溪和书堂，故人称濂溪先生，元公是他的谥号。他与邵雍，张载，程颢，程颐并称为“北宋五子”。周敦颐生前的确也以他的实际行动，成就了一代大儒的风范，他的人品和思想，千百年来一直为人们敬仰。
熙宁五年（1072年），周敦颐不幸感染了瘴疠（zhàng lì），辞官归隐定居在庐山莲花峰下，他将母亲的坟墓也从润州迁来葬在离他居所很近的地方。他将门前的小溪正式命名为家乡的“濂溪”。定居于江西庐山濂溪书堂。1073年7月23日，病死于庐山濂溪书堂，终年57岁。
名篇赏析《爱莲说》 水陆草木之花，可爱者甚蕃。晋陶渊明独爱菊；自李唐来，世人盛爱牡丹；予独爱莲之出淤泥而不染，濯清涟而不妖，中通外直，不蔓不枝，香远益清，亭亭净植，可远观而不可亵玩焉。
予谓菊，花之隐逸者也；牡丹，花之富贵者也；莲，花之君子者也。噫！菊之爱，陶后鲜有闻。莲之爱，同予者何人?牡丹之爱，宜乎众矣。
《释文》水上地上各种草和木的花，值得喜爱的是很多的。晋朝陶渊明唯独喜爱菊花。从唐朝以来，世上的人们非常喜爱牡丹。我唯独喜爱莲花，它从污泥中长出来，却不受到污染，在清水里洗涤过但是不显得妖媚，它的茎中间贯通，外形挺直，不缠生藤蔓，不旁出冗枝，香气远播，更加清香，笔直地洁净地立在那里，可以远远地观赏但是不能贴近去轻慢地玩弄啊。
我认为，菊花是花中的隐士；牡丹，是花中的富贵者；莲花，则是花中的君子。唉！自从陶渊明以后很少听到过爱菊花的人了。像我一样爱莲花的人还有多少呢？但是爱牡丹的人却像星星一般的多。
